Jacob Nampudakam a fait ses études au séminaire Saint-Charles de Nagpur dans l'État de Maharashtra. Après avoir suivi sa formation en théologie, il est ordonnéprêtre en 1981 pour les Pallottins et devient vicaire, puis curé et plus tard maître des novices de la province de la congrégation de Nagpur et directeur du Centre d'animation pallottine. Il poursuit ensuite ses études de philosophie à l'université pontificale grégorienne, ainsi que des études de psychologie et de spiritualité.
Jacob Nampudakam est nommé par le recteur général des Pallottins Séamus Freeman, secrétaire général de la congrégation à Rome, où il s'engage surtout pour le domaine de l'éducation. De 2004 à 2010, il est conseiller général de la congrégation des Pallottins.
La XXe assemblée générale des Pallottins du qui se tient à Ariccia, près de Rome, élit le Père Nampudakam comme nouveau recteur général. C'est le premier non-européen élu à ce poste[2].