Après une année à jouer au baseball au Miami Dade College, Jharel Cotton reçoit à l'été 2010 une offre des Dodgers de Los Angeles, qui lui offrent un contrat assorti d'une prime à la signature de 125 000 dollars, mais il refuse et choisit de retourner à son collège pour une seconde année, espérant ainsi améliorer ses chances d'être choisi par un club de la Ligue majeure de baseball au repêchage annuel des joueurs amateurs[1]. Cotton est effectivement repêché par les Mets de New York en , ceux-ci le réclamant au 28e tour de sélection[2]. Le jeune homme repousse cependant l'offre des Mets et s'engage à l'université de l'Est de la Caroline, où il joue pour l'équipe des Pirates[3]. Il signe enfin son premier contrat professionnel après avoir été repêché par les Dodgers de Los Angeles au 20e tour de sélection en [4].