Manny Acta est recruté comme agent libre amateur par les Astros de Houston en 1986. Il joue quatre saisons en Ligues mineures au sein de l'organisation des Astros, passant du niveau rookie au Double-A. Transféré en 1991 chez les Braves d'Atlanta, il se contente de jouer une saison supplémentaire en Ligues mineures, au niveau Simple-A[1].
Manny Acta dirige les Nationals de Washington du début de la saison 2007 au 13 juin2009, date à laquelle il a été congédié[2]. Son bilan comme manager des Nationals est de 158 victoires et 252 défaites, pour un pourcentage de victoires de 0,385.
Il est nommé manager des Indians de Cleveland le 25 octobre 2009[3]. Cleveland termine la saison en quatrième position sur cinq clubs dans la division Centrale, avec une fiche perdante de 69-93. En 2011, il mène les Indians à une surprenante saison qui voit l'équipe, malgré plusieurs joueurs blessés, occuper pendant de nombreuses semaines le premier rang de la division Centrale. Elle termine finalement deuxième avec 80 victoires et 82 défaites, une amélioration de 11 victoires. Le lendemain du dernier match, les Indians indiquent que Acta restera en poste au moins jusqu'en 2013[4]. Cependant, la saison 2012 des Indians s'avère très décevante et le club congédie Acta le pour le remplacer par Sandy Alomar, Jr.[5]. Les Indians ont alors 66 victoires et 91 défaites. En presque 3 saisons complètes à Cleveland, les Indians cont gagné 215 parties et en ont perdu 266 avec Acta aux commandes.