Morten Løkkegaard est diplômé de l'école de journalisme du Danemark, à Aarhus, en 1988. Il est alors recruté par le Jyllands-Posten, où il reste jusqu'en 1990, année où il devient journaliste et présentateur pour les journaux télévisés de DR. Il quitte le groupe en 2005 pour devenir consultant en communication[1].
Il est candidat à un second mandat lors des élections de 2014, mais échoue à être réélu et devient alors le premier suppléant de son parti[4]. En , il est désigné candidat par son parti pour les élections législatives de 2015[5]. Il est élu au Folketing le , où il devient le porte-parole de son groupe parlementaire sur les questions de médias et sur l'Europe[6],[1].
En , après que le président américain Donald Trump ait exprimé son souhait d'intégrer le Groenland aux États-Unis, Løkkegaard prend position pour un retour du territoire autonome danois au sein de l'Union européenne[12].