Munakata est née à Hiroshima mais sa famille déménage au Brésil à São Paulo quand elle a deux ans[3]. À quatre ans, elle prend ses premiers cours de piano et commence à sept ans à chanter dans la chorale que son père dirige[4]. Elle apprend aussi le violon et la harpe. Elle étudie à l'institut musical de São Paulo et obtient un diplôme en composition et direction de chorale en 1978[4],[5].
Munakata fut professeure et directrice de l'école municipale de musique de São Paulo et cheffe de chœur et directrice artistique de la chorale Jovem do Estado (la plus jeune de l'État)[3]. Elle anime régulièrement un programme à la radio intitulé Vozes (Voix) sur Rádio Cultura FM à São Paulo, émission thématique sur la chorale[4],[7].
↑(pt-BR + ja) Jo Takahashi, «S.O.S JAPÃO», sur JOJOSCOPE, (consulté le )
↑(ja) «■ Fuhō ■ Munakata Naomi-san korona de byōshi – San Pauro shūritsu kōkyō gakudan gasshō-dan no shikisha» [«[Obituary] Naomi Munakata died from coronavirus disease – Conductor of the São Paulo State Symphony Orchestra Choir»], Nikkey Shimbun, (lire en ligne, consulté le )