Le , Fischl fut arrêté dans le cadre de l'affaire impliquant le diplomate américain et activiste marxiste Noel Field et accusé de haute trahison dans ce qui allait devenir les procès de Prague. L'antisémitisme, tout comme dans le complot des blouses blanches, y joua un rôle important, Fischl, comme la majorité de ses coaccusés, étant d'origine juive. En tant que vice-ministre des finances, il avait pourtant été la terreur des émigrants juifs: de par ses informateurs dans les cercles d'émigrants, il transforma la chasse aux biens cachés en une sorte de sport privé, n'hésitant pas à se déplacer à l'aéroport pour vérifier les biens que les émigrants emportaient, les confisquant s'ils n'avaient pas été autorisés[1], ce qui lui valut le surnom de «Himmler juif»[2]: «Cet homme, qui avait prononcé des discours acerbes contre les émigrants juifs - on peut les lire dans les journaux - aurait pu être le complice de Slansky en faveur des émigrants juifs? - Mais un véritable procureur communiste ne se laisse pas abuser par de telles contradictions. Donc, tout simplement, les discours de Fischl contre les actions illégales des émigrants juifs n'ont été qu'un camouflage; ses confiscations personnelles aux postes frontières n'ont été qu'une ruse pour dissimuler ses "activités de sabotage avec les riches émigrants juifs".»[3]. On le fit aussi s'accuser d'être «un Juif bourgeois nationaliste»[4].
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