Le , il est nommé directeur délégué aux programmes de France 5. Il prend ses fonctions le . Le , il est nommé directeur de l'antenne et des programmes de France 5 après le départ d'Alexandre Michelin.
En , il décide de supprimer de l'antenne de France 5 l'émission du journaliste Daniel SchneidermannArrêt sur images, une des plus anciennes émissions de France 5, la jugeant «usée»[2].
En 2010, il est nommé directeur de l'antenne et des programmes de France 2. À ce poste, il accumule les échecs, notamment celui, retentissant, de Jusqu'ici tout va bien, avec Sophia Aram, projet qu'il avait, selon le journal Libération, «porté et défendu»[3], mais aussi d'autres ratés comme le jeu culinaire Dans la peau d’un chef, ou avant le 20 heures, la fiction courte Y a pas d’âge avec Claude Brasseur, Marthe Villalonga et Arielle Dombasle… À la rentrée 2012, il avait lancé Bruce Toussaint, avec Vous trouvez ça normal?, le vendredi en fin de soirée, Roumanoff et les garçons, avant le 20 heures et vite supprimée. Philippe Vilamitjana a d'autre part mis fin en à l'émission de Philippe Lefait, Des Mots de minuit[4]. Il propose à Thierry Ardisson de revenir sur le service public, lequel décline la proposition[5]. Face à ces échecs successifs, il est limogé de son poste durant le week-end du 19- et remplacé par Thierry Thuillier[6]. Thierry Ardisson lui impute les difficultés actuelles de France 2 expliquant que ce directeur n'a jamais voulu faire de place à une émission « culturelle » de bon aloi[5].