Même si sa moyenne chute à ,263 en 133 matchs avec Pittsburgh en 2007, le receveur dominicain totalise 120 coups sûrs, dont 11 circuits, et produit de nouveau 55 points.
Paulino s'aligne deux saisons avec les Marlins. En 2009 il est le substitut du receveur John Baker[2]. L'année suivante, ces deux joueurs partagent le travail derrière le marbre avec Brett Hayes[3].
Le , Ronny Paulino est suspendu pour 50 parties par la Ligue majeure de baseball après avoir échoué un test antidopage, ce qui met immédiatement fin à sa saison. La MLB ne révèle pas la nature de la substance interdite dont Paulino a fait usage, mais le joueur affirme qu'un supplément diététique violant la politique antidrogue de la ligue pourrait être en cause[4].
Mets de New York
En , Paulino, devenu agent libre, signe un contrat d'une saison pour 1,3 million de dollars avec les Mets de New York[5]. Il frappe pour ,268 et produit 19 points en 78 parties jouées en 2011 comme substitut au receveur Josh Thole.