Après des réparations à Truk, le Samidare est attribué à la force de bombardement du Contre-amiral Abe Hiroaki, participant à la première bataille navale de Guadalcanal dans la nuit du 12 au . Il participe au naufrage du destroyer USSMonssen et endommage le croiseur USSHelena. Après la bataille, il sauve la 207 survivants de son sister-shipYūdachi, qu'il tente vainement de saborder avec ses torpilles.
Au cours de la deuxième bataille navale de Guadalcanal dans la nuit du 14 au , avec son escadre commandée par le navire amiralNagara, le Samidare participe aux naufrages des destroyers USSBenham, Walke, Preston et endommage le Gwin. Après la bataille, il sauve des survivants du cuirassé Kirishima, atteignant Truk le . À la fin du mois, il revient à Yokosuka pour des réparations. À la fin de décembre, il retourne à Truk en escortant le croiseur lourdTakao.
À la mi-, le Samidare escorte le porte-avionsJun'yō de Truk à Palau puis Wewak. Après avoir évacuer des troupes à Guadalcanal en février, opération Ke, il couvre des opérations de transport de troupes en Nouvelle-Guinée, à Kolombangara et à Tuluvu jusqu'à la fin du mois d'avril. En mai, il retourne à Yokosuka, faisant partie de l'escorte du cuirassé Yamato, patrouillant ensuite dans les eaux du nord avec les croiseurs Myōkō et Haguro, pour couvrir l'évacuation des forces Japonaises de Kiska. Il retourne à Yokosuka le avec le croiseur Maya pour des réparations. En septembre, le Samidare escorte les porte-avions Taihō et Chūyō à Truk, il évacue des troupes à Kolombangara, où il subit une attaque de destroyers américains le , ayant des dégâts mineurs. Au cours de la bataille de Vella Lavella les 6 et , le Samidare torpille le destroyer USSSelfridge. Il est également présent lors de la bataille de la baie de l'Impératrice Augusta le . Au cours de la bataille, le Samidare torpille le destroyer USSFoote et entre en collision avec son sister-ship Shiratsuyu, endommageant sa coque. Il fait route vers l'arsenal naval de Yokosuka qu'il atteint à la mi-décembre.
En , le Samidare escorte des convois de troupes du Japon pour Saipan et de Truk pour Palau. Le , il participe au sauvetage des survivants du croiseur Yūbari. De mai à début juin, le Samidare couvre des évacuations à Biak et dans d'autres endroits des Indes Néerlandaises. Il participe à la bataille de la mer des Philippines les 19 et , avec la force de l'Amiral Takatsugu Jōjima. En juillet, il escorte un convoi de troupes à Okinawa et à Lingga, de retour avec le Kinu à Palau en août. Le , le Samidare s'échoue accidentellement sur le récif Velasco, à proximité de Palau, à la position 8° 10′ N, 134° 38′ E. Le , il est torpillé par le sous-marin USSBatfish. Le destroyer se casse en deux et la poupe coule, la proue sera détruite par les Japonais.