Le Schleswig-Holstein a été déployé au sein de la Force opérationnelle maritime de la Force intérimaire des Nations unies au Liban (FINUL) de septembre à décembre 2009, servant de navire amiral du commandant de la force, l'amiral de flottille Jürgen Mannhardt[2]. Le 19 mai 2010, il a relevé la frégate Emden lors de l'opération Atalante au large de la Corne de l'Afrique. Il a passé 124 jours avec la force opérationnelle. Conjointement avec le navire amiral de l'EUNAVFOR, le De Grasse, il a participé à l'escorte de navires du Programme alimentaire mondial et de la Mission de l'Union africaine en Somalie (AMISOM). Le Schleswig-Holstein a été remplacé dans cette mission par la frégate Köln en septembre 2010[3].
De juin à décembre 2014, le Schleswig-Holstein a été déployé pour le compte de l'Organisation pour l'interdiction des armes chimiques (OIAC), escortant le MV Cape Ray à travers la mer Méditerranée, remplaçant ainsi la frégate Augsburg qui assurait précédemment cette escorte. Le Cape Ray participait à la destruction d'armes chimiques syriennes[4],[5]. À l'issue de cette mission, le Schleswig-Holstein a été déployé dans le cadre des exercices Cougar 2014 en Méditerranée et dans le golfe Persique, où il a escorté un groupe amphibie britannique composé du HMS Ocean (L12), du HMS Bulwark (L15), du RFA Lyme Bay et du RFA Wave Knight[6].
De juin à novembre 2015, le Schleswig-Holstein a été déployé avec la mission EUNAVFOR MED en Méditerranée, participant au sauvetage de migrants naufragés et autres personnes en danger[7],[8],[9],[10],[11],[12]. Le 22 juillet, il a secouru 111 personnes[13]. Le 24 août, une Somalienne enceinte, secourue d'une embarcation de réfugiés par le HMS Enterprise (H88), a accouché à bord du navire, le premier enfant jamais né sur un navire de la marine allemande. Sur la suggestion du personnel médical présent, l'enfant a été prénommée Sophia[14]. Ce nom était associé aux navires de la marine allemande nommés Schleswig-Holstein, car le destroyer Schleswig-Holstein avait utilisé l'indicatif radio « Sophie X ». Ce dernier faisait référence au cuirassé SMS Schleswig-Holstein, dédié à la princesse Louise-Sophie de Schleswig-Holstein-Sonderbourg-Augustenbourg, comme l'ont fait d'autres navires portant ce nom par la suite[15]. L'EUNAVFORMED fut ensuite rebaptisée « Opération Sophia », en hommage au bébé né à bord du Schleswig-Holstein[15],[16]. Après avoir participé au sauvetage de 4224 naufragés, le Schleswig-Holstein est rentré à son port d'attache de Wilhelmshaven le 9 novembre 2015[17].