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Mills commence sa carrière à 16 ans comme DJ dans la station locale de Southampton Power FM après lui avoir envoyé des cassettes démos. Il vient ensuite sur GWR FM Bristol pendant deux ans puis sur Key 103 à Manchester. En 1995, il travaille pour la radio de LondresHeart 106.2.
Scott Mills rejoint BBC Radio 1 en 1998 pour animer la tranche entre 4 heures et 7 heures. En , Mills passa à un créneau d'après-midi le week-end pendant un peu plus de six mois, mais en , il remplace Sara Cox, animatrice pendant la semaine. Comme elle décide de ne pas revenir, l'émission devient le The Scott Mills Show. Il anime l'été The Radio 1 Breakfast Show ou le Top 50.
Le Scott Mills Show, tel qu'il est actuellement présenté, se déroule du lundi au vendredi de 13h à 16h et est actuellement coprésenté par Chris Stark.
Spectacle
Le , on annonce qu'une comédie musicale basée sur la vie de Scott Mills sera présentée au festival d'Édimbourg 2009. La comédie musicale dure trois nuits du 11 au au Pleasance One Theatre à Édimbourg. La comédie musicale est née d'une rumeur sur Internet selon laquelle Mills jouerait dans Rick Rolling The Musical comme Rick Astley et d'autres musiciens des années 1980. Il nie cette rumeur sur son émission de radio et les suggestions des auditeurs pour créer une comédie musicale basée sur sa vie devient une réalité. Certaines chansons pour la comédie musicale sont composées et envoyées par les auditeurs de son émission de radio.
Mills fait un autre spectacle pour 2010. Il a été mis au défi de faire un one-man show, comme l'ont fait ses coanimateurs Rebecca Huxtable et Mark Chapman. Mills donne 'The Bjorn Identity, l'histoire de Jason Bjorn, un Jason Bourne qui se croit Björn Ulvaeus.
Télévision
En plus de la radio, Scott Mills fait parfois des apparitions à la télévision. Il joue parfois son propre rôle. Il est le journaliste Carl Land dans la série Casualty dans des épisodes de 2006 et 2007.
Il est, avec Edith Bowman, le narrateur de The Pop Years. Il présente des programmes de grande envergure, notamment le tirage au sort de la National Lottery du mercredi soir sur BBC 1.
En , il présente sur BBC Three un documentaire The World's Worst Place to Be Gay?[2].
