Fils de maraîchers, Sébastien Vauxion quitte le lycée quelques mois avant le bac pour se lancer dans une formation de pâtissier[5]. Il intègre l'école de pâtisserie d'Yssingeaux avant d'être formé par plusieurs chefs comme Pierre Hermé, Yannick Alléno ou Pierre Gagnaire[6].
En , Sébastien Vauxion rejoint le groupe K2 Collections où il supervise la pâtisserie des trois établissements du groupe dont le Kintessence, restaurant deux étoiles.
Fort du succès du tea time dans ses restaurants[7], il ouvre mi- le SarKara au K2 Palace (Sarkara voulant dire «fragment de sucre» en sanskrit[8]). Le restaurant occupe les murs du restaurant Kintessence de 13h00 à 15h30. Il s'agit d'un projet de restaurant travaillant exclusivement le sucré comme un véritable restaurant[9], avec les codes de la haute gastronomie, un format amuse-bouches-entrée-plat-dessert, la construction d’une véritable carte et des accords boissons[10].
En , son restaurant obtient une étoile au guide Michelin[7].
En , Sébastien Vauxion participe au tournage d'une épreuve du concours Top Chef, diffusée dans le troisième épisode de la saison 11 le [11].
En , un an après la première étoile, son restaurant décroche une deuxième étoile Michelin[3]. Il est le premier pâtissier à décrocher cette distinction[12].
En février 2024, Sébastien Vauxion est élu meilleur pâtissier du monde pour l'année 2024 par l'association Les Grandes Tables du Monde[13].