Trèfle bêta

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Un trèfle β est une structure protéique comprenant trois séquences β–β–β–boucle–β repliées de telle sorte que deux épingles à cheveux β à deux brins se forment avec le premier et le dernier brin β pour la première, et avec les deuxième et troisième brins β pour la seconde épingle à cheveux β. L'ensemble forme un tonneau β de 1,6 nm de diamètre avec une coiffe triangulaire et une symétrie approximativement d'ordre 3[1],[2].

Parmi les protéines qui présentent un domaine en trèfle β, on peut noter les inhibiteurs à domaine de Kunitz (en) de plantes telles que le soja, l'arbre corail africain (en) et le blé ; les cytokines de la famille des interleukines 1 (interleukine 1α (en), interleukine 1β, antagoniste du récepteur des interleukines 1 (en)) ainsi que des facteurs de croissance des fibroblastes 1 (en) et 2 (en).

Faits en bref Pfam, Clan Pfam ...
Domaine de liaison à l'ADN en trèfle β
Description de cette image, également commentée ci-après
CSL lié à l'ADN (PDB 1TTU[3])
Domaine protéique
Pfam PF09270
Clan Pfam CL0066
InterPro IPR015350
SMART SM01268
SCOP 1ttu
SUPERFAMILY 1ttu
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Faits en bref Pfam, Clan Pfam ...
Domaine lectine en trèfle β de type ricine
Description de cette image, également commentée ci-après
Structure cristalline d'une abrine a (PDB 1ABR[4])
Domaine protéique
Pfam PF00652
Clan Pfam CL0066
InterPro IPR000772
SMART SM00458
PROSITE PS50231
SCOP 1abr
SUPERFAMILY 1abr
CAZy CBM13
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Faits en bref Pfam, Clan Pfam ...
Domaine lectine 2 en trèfle β de type ricine
Domaine protéique
Pfam PF14200
Clan Pfam CL0066
InterPro IPR000772
SMART SM00458
PROSITE PS50231
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Notes et références

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