L'USS Chicago, toujours comme navire amiral de l'Escadre de l'évolution est resté le long des côtes orientales de l'Amérique du Nord et du Sud, ainsi que et dans les Caraïbes, puis comme navire amiral de l'escadre de l'Atlantique Nord jusqu'en 1893. Après avoir pris part à la revue navale internationale à Hampton Roads en avril, il a quitté New York le vers l'Europe et la Méditerranée en tant que navire amiral de la flotte américaine stationnée en Europe. Durant cette période, le navire a été commandé par Alfred Thayer Mahan, déjà célèbre en tant que stratège naval. L'USS Chicago revient à New York le où il a été placé en réserve dès le 1er mai.
Remis en service le , l'USS Chicago repasse dans les Caraïbes avant de rejoindre son stationnement en Europe le . Puis il revient à New York le pour participer à la parade navale de célébration George Dewey du .
Il repart de New York le pour reprendre son stationnement en Atlantique sud comme navire amiral de l'escadre de l'évolution jusqu'en 1901. Puis il revient croiser en Europe du Nord, en Méditerranée puis dans les eaux des Caraïbes jusqu'au . Il est présent à Oyster Bay, New York, lors de la revue navale présidentielle.
Du au , l'USS Chicago subit des réparations à Boston. Après avoir navigué le long de la côte nord-est, le croiseur quitte Newport News en Virginie le pour arriver à Valparaíso, au Chili le . Là, dès le , il relève le croiseur cuirasséUSSNew York(ACR-2) en tant que navire amiral du stationnement du Pacifique, pour trois ans, croisant au large des côtes ouest de l'Amérique du Nord et du Sud, aux Caraïbes et à Hawaï.
En 1906, il joue un rôle clé dans l'évacuation de San Francisco pendant le grand tremblement de terre.
Le , l'USS Chicago quitte San Diego pour la côte Est et rejoint l'escadre de l'Académie navale pour des exercices d'été sur la côte nord-est jusqu'au , date à laquelle il entre dans la réserve.
Il est remis en service l'été suivant ( - ) pour des exercices de formation puis revient à Annapolis. Le , il quitte l'Académie pour arriver à Boston le . Il est ensuite mis en réserve auprès de la milice navale du Massachusetts, jusqu'au , puis avec la milice navale de Pennsylvanie du à .
Première guerre mondiale et après
Le , de sa base de Philadelphie, l'USS Chicago est remis en service en tant que navire amiral de l'escadre d'alerte sous-marine en Atlantique.
Le , il quitte New York pour rejoindre la 2edivision de croiseur (CruDiv 2), comme navire amiral dans le Pacifique. Il est reclassé «CA-14» (croiseur lourd) en 1920 puis «CL-14» (croiseur léger) en 1921.
De à , il sert à la 14edivision de sous-marins à la base de Pearl Harbor.
L'USS Chicago est déclassé à Pearl Harbor, le et utilisé comme de navire de réception jusqu'en 1935. Il est rebaptisé USS Alton le avec un reclassement «IX-5», et vendu le .
L'USS Alton sombre dans le Pacifique en juillet alors qu'il était remorqué de Honolulu à San Francisco.