Membre du Parti de l'alliance nationale, dont il devient à terme le président, il se présente sans succès aux élections législatives de 2002, de 2007 et de 2012, avant de remporter largement la circonscription de Namatanai (en Nouvelle-Irlande) aux élections de 2017, face à son cousin le député sortant Byron Chan(en). Il est fait whip de l'opposition parlementaire menée par Patrick Pruaitch, mais rejoint en août 2019 la majorité parlementaire du Premier ministre James Marape. En octobre 2020 il est nommé ministre de la Culture, du Tourisme et du Musée national, alors que les industries de ces domaines sont durement affectées par la pandémie de Covid-19 en Papouasie-Nouvelle-Guinée. En décembre, il est transféré au poste de ministre de la Foresterie[1],[2],[5]. En janvier 2022, à celui de ministre de l'Aviation civile[6].
Après les élections de 2022, remportées par James Marape et ses alliés, Walter Schnaubelt est fait ministre des Transports et de l'Aviation civile[7]. Il devient également le chef du Parti de l'alliance nationale, succédant à Allan Bird[8]. En mars 2023, s'adressant à la Commission de réforme constitutionnelle, il propose l'adoption d'un système fédéral où les provinces de Papouasie-Nouvelle-Guinée deviendraient des États avec une autonomie accrue, une forme de décentralisation. Il propose aussi un parlement fédéral bicaméral comprenant un sénat qui serait composé des gouverneurs des États. Il propose enfin que le Premier ministre de Papouasie-Nouvelle-Guinée ne soit plus élu par le Parlement mais par les citoyens au suffrage universel direct avec un mandat de cinq ans, et que la responsabilité de chaque autre ministère soit confiée à un technocrate et non plus à un député[9].