Les recherches archéologiques montrent que les premiers colons de Wasilków apparaissent au Mésolithique[3]. Les premières mentions de la ville remontent au XIIIe siècle. Après 1509, Nicolas II Radziwiłł construit un manoir au bord de la rivière. La ville est officiellement fondée sur l'ordre de Sigismond Augustus en 1566 et le 8 décembre 1566, elle obtient des privilèges[1]. Le starost est Hiob Bretfus, l'architecte de la cour du roi Sigismond Ier l' Ancien . Dès lors, les habitants doivent être jugés et gouvernés selon la loi de Magdebourg[1]. En 1566, une église orthodoxe en bois a été érigée à Wasilków[4]. En 1576, Łukasz Górnicki devient le starost[3].
Au milieu du XVIIe siècle, la commune est habitée par environ 500 habitants[3]. Avant la première partition de la Pologne, 1 500 personnes vivaient à Wasilków, dont environ 100 uniates et 150 juifs. Après la troisième partition en 1795, Wasilków est incorporée à la Prusse, et en 1807 à la partition russe[3].
La ville est revenue à la Pologne après avoir retrouvé son indépendance en 1918. Il y a une église catholique, une église orthodoxe et une synagogue que les Allemands brûlent en 1941. En 1929, des usines de draps, des moulins et des scieries s'y établissent.
Le 16 septembre 1939, Wasilków est attaqué par l'armée allemande, une semaine plus tard l'Armée rouge entre[3]. En août 1941, les Allemands y établissent un ghetto pour la population juive, où plus de 1 000 personnes sont détenues. Le ghetto est liquidé le 2 novembre 1942[5]. Les Juifs sont déportés au camp de transit de Białystok[5] et de là au camp d'extermination de Treblinka[6].