2004年、ブリティッシュ・エアウェイズの社員だったデーブ・スパーロックが設立した。当初はアトランティック・エクスプレスという社名だったが、2005年にeos航空へ変更した[1]。
2005年10月28日、eos航空はニューヨークとロンドン・スタンステッド空港間の運航を開始した。一日に2便、もしくは4便を運航し、2007年には、ニューヨーク～ロンドン間で4番目に便数が多い航空会社になった[2][3][4]。
パリやドバイ、ワシントンD.C、ボストン、ロサンゼルスに就航する予定だったが実現しなかった[5][6][7]。
2008年4月27日に運航を停止。破産した。
