ETSファミリー
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| Ets-domain | |||||||||||
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ETS1のDNA結合自己阻害構造[1] | |||||||||||
| 識別子 | |||||||||||
| 略号 | Ets | ||||||||||
| Pfam | PF00178 | ||||||||||
| Pfam clan | CL0123 | ||||||||||
| InterPro | IPR000418 | ||||||||||
| SMART | SM00413 | ||||||||||
| PROSITE | PDOC00374 | ||||||||||
| SCOP | 1r36 | ||||||||||
| SUPERFAMILY | 1r36 | ||||||||||
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ETSファミリー(E26 transformation-specific[2]/erythroblast transformation specific[3])は、転写因子のファミリーとして最大級のものの1つであり、動物に特有のファミリーである。ヒトでは28種類[4]、マウスでは27種類、線虫Caenorhabditis elegansでは10種類、ショウジョウバエでは9種類の遺伝子が存在する。このファミリーの転写因子として最初に発見された因子は、急性白血病ウイルスE26によって導入された遺伝子として同定された。このファミリーのメンバーは、さまざまな組織の発生やがんの進行への関与が示唆されている。
ETSファミリーの転写因子は、下に示す12種類のサブファミリーへ分類される[5]。
| サブファミリー | 哺乳類のメンバー | 無脊椎動物のオルソログ |
|---|---|---|
| ELF | ELF1, ELF2 (NERF), ELF4 (MEF) | |
| ELG | GABPα | ELG |
| ERG | ERG, FLI1, FEV | |
| ERF | ERF (PE2), ETV3 (PE1), ETV3L | |
| ESE | ELF3 (ESE1/ESX), ELF5 (ESE2), EHF (ESE3) | |
| ETS | ETS1, ETS2 | POINTED |
| PDEF | SPDEF (PDEF/PSE) | |
| PEA3 | ETV4 (PEA3/E1AF), ETV5 (ERM), ETV1 (ER81) | |
| ER71 | ETV2 (ER71) | |
| SPI | SPI1 (PU.1), SPIB, SPIC | |
| TCF | ELK1, ELK4 (SAP1), ELK3 (NET/SAP2) | LIN |
| TEL | ETV6 (TEL), ETV7 (TEL2) | YAN |
構造と機能
ETSファミリーのメンバーはETSドメインを持ち、このドメインは3本のαヘリックスと4本の逆平行βシートからなるウィングドヘリックス構造(ヘリックスターンヘリックスの変種)を有する。α3ヘリックスは二本鎖DNAの主溝に挿入され、GGA(A/T)配列を認識する[6]。ETSドメインはDNA結合以外に、タンパク質間相互作用にも関与している[7]。
DNA結合を担うETSドメインはETSファミリーの中でも広範囲にわたって高い保存性がみられ、そのためDNA結合には大きな冗長性が存在する。他のタンパク質との相互作用はDNAへの特異的結合を可能にしている方法の1つであると考えられており、ETSファミリーのタンパク質は複数のシグナル伝達経路が収束する地点の1つとなっている[8]。ETSファミリータンパク質は、転写のリプレッサー、アクチベーター、そしてその双方として機能する場合がある[9]。個々のETSファミリータンパク質のETSドメイン外の配列は極めて多様であり、こうした領域を介してアクチベーターやリプレッサーとしての機能、特定のシグナル伝達経路への応答が可能となっている[10]。