Ku自己抗原
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| XRCC5 | |
|---|---|
 | |
| 識別子 | |
| 略号 | XRCC5 |
| 他の略号 | Ku80 |
| Entrez | 7520 |
| HUGO | 12833 |
| OMIM | 194364 |
| PDB | 1JEY (RCSB PDB PDBe PDBj) |
| RefSeq | NM_021141 |
| UniProt | P13010 |
| 他のデータ | |
| 遺伝子座 | Chr. 2 q35 |
| XRCC6 | |
|---|---|
| 識別子 | |
| 略号 | XRCC6 |
| 他の略号 | Ku70, G22P1 |
| Entrez | 2547 |
| HUGO | 4055 |
| OMIM | 152690 |
| PDB | 1JEY (RCSB PDB PDBe PDBj) |
| RefSeq | NM_001469 |
| UniProt | P12956 |
| 他のデータ | |
| 遺伝子座 | Chr. 22 q11-q13 |
| Ku70/Ku80のN末端ドメイン | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| 識別子 | |||||||||
| 略号 | Ku_N | ||||||||
| Pfam | PF03731 | ||||||||
| Pfam clan | CL0128 | ||||||||
| InterPro | IPR005161 | ||||||||
| SCOP | 1jey | ||||||||
| SUPERFAMILY | 1jey | ||||||||
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| Ku70/Ku80の中央ドメイン | |
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| 識別子 | |
| 略号 | Ku |
| Ku70/Ku80のC末端アーム | |||||||||
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| 識別子 | |||||||||
| 略号 | Ku_C | ||||||||
| Pfam | PF03730 | ||||||||
| InterPro | IPR005160 | ||||||||
| SCOP | 1jey | ||||||||
| SUPERFAMILY | 1jey | ||||||||
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| KuのC末端ドメイン様タンパク質 | |||||||||
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 Ku86のC末端領域の溶液構造 | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| 略号 | Ku_PK_bind | ||||||||
| Pfam | PF08785 | ||||||||
| InterPro | IPR014893 | ||||||||
| SCOP | 1q2z | ||||||||
| SUPERFAMILY | 1q2z | ||||||||
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Ku自己抗原（Ku autoantigen、しばしば「Ku」とのみ表記される）は、DNA二本鎖切断末端に結合する二量体タンパク質複合体であり、DNA修復の非相同末端結合（NHEJ）経路に必須の生体分子である。
Kuは細菌から人間まで広範囲の生物に進化的に保存されている。祖先の細菌Kuはホモ二量体である[2]。真核生物のKuは、Ku70（XRCC6）とKu80 （XRCC5）という2つのポリペプチドのヘテロ二量体であり、それらの名称の由来はヒトKuサブユニットの分子量がそれぞれ約70 kDaと80 kDaであるためである。2つのKuサブユニットはどちらも、DNA末端を通すバスケット型の構造を形成している。これらが会合すると、KuはDNA鎖を滑り、より多くのKu分子が末端を通ることができるようにする。高等真核生物では、KuはDNA依存性プロテインキナーゼ触媒サブユニット（DNA-PKcs）と複合体を形成し、完全なDNA依存性プロテインキナーゼであるDNA-PKを形成する[3]。Kuは、NHEJに関与する他のタンパク質が結合できる足場分子として機能し、二本鎖切断部をライゲーション反応に適した配向に配置すると考えられている。
Ku70およびKu80タンパク質はどちらも、3つの構造ドメインから構成されている。 N末端ドメインはα/βドメインであり、その構造にはロスマンフォールドの6本鎖βシートが含まれる[4]。このドメインは二量体の相互作用面に小さな寄与を果たす。中央ドメインは、 DNA結合性βバレルドメインである。KuはDNAの糖リン酸骨格とわずかに接触するだけでDNA塩基とは接触しないが、二重らせんの主溝と副溝の輪郭に立体的に適合し、二重鎖DNAを囲む閉環を形成する。Kuは、切断された2つのDNA末端の間に架橋を形成することにより構造的な支持と整列を行い、末端を分解から保護し、無傷なDNA部分への無差別な結合を防ぐ。Kuは、DNAポリメラーゼ、ヌクレアーゼ、およびリガーゼが損傷DNA末端にアクセスできるようにしながら、DNAを効果的に配置させ、二つの末端間の結合を促進する[5]。C末端アームは、他方のサブユニットの中央ドメインのβバレルドメインを包み込むαヘリックス領域である。これら3つのドメインのほかに4番目のドメインがC末端に存在する場合もあり、DNA-PKcsに結合する[6]。
Kuの両方のサブユニットについて、マウスで遺伝子をノックアウトする実験が行わている。これらのマウスでは染色体の不安定性が示され、Ku並びにNHEJがゲノムの維持に重要であることを明らかにした[7][8]。
多くの生物では、KuはDNA修復に加えて、テロメアにおいて役割を持つ[9]。
Ku80の豊富さは、種の寿命の長さに関係しているという研究結果もある[10]。