体操を習っていて、体操教師にすすめられ、10歳でパリ・オペラ座付属バレエ学校に入学。1989年入団。1991年にコリフェ、1992年にスジェに昇進し、同年ヴァルナ国際バレエコンクールのジュニア部門で金メダルを受賞。1996年にプルミエール・ダンスーズに、1998年、ルドルフ・ヌレエフ演出『ドン・キホーテ』の舞台後、エトワールとなった。
2003年、キーロフ・バレエのゲストとして、『ロミオとジュリエット』をアンドリアン・ファデーエフとともに踊った。
マニュエル・ルグリとのパートナーシップが特に名高い。
2014年5月29日、フランスの日刊紙「フィガロ」はメートル・ド・バレエのクロチルド・ヴァイエ(元パリ・オペラ座プルミエール・ダンスーズ)の後任として、2015年5月引退予定のデュポンが就任することを報じた[4]が、デュポンはこれを辞退した。
2015年5月18日公演の『マノン』を最後の舞台として、現役ダンサーを引退した[2]。2016年2月4日、振付家バンジャマン・ミルピエ(英語版)の後任としてパリ・オペラ座バレエ舞踊監督に指名され、2016年8月1日から正式に就任した[5]。2022年6月16日にデュポンの舞踊監督辞任が発表され、同年7月末で辞任した[3]。