カラーメダカ

野生のメダカが焦げ茶色がかった灰色および黒色であるのに対し、カラーメダカはメダカの本来の色素胞の有無、強弱により、黒色（メラノフォア）、黄色（キサントフォア）、白色（ロイコフォア）、虹色（イリドフォア）が反応して違うタイプが出現する。

ヒメダカ（緋目高）

黒色素胞がないため体色がオレンジ色または黄色をしている。観賞用や肉食魚の餌用に流通している。

シロメダカ（白目高）

黒色素胞がなく黄色素胞が発達していないため、体は白い。

アオメダカ（青目高）

黄色素胞がなく、体色は青っぽい。

上記の3種を基本にして、改良されている。

• 赤色の要素が強いヒアカメダカ、楊貴妃メダカ
• 復帰突然変異による黒色が戻ったチャメダカ（茶目高）
• チャメダカとヒメダカの戻し交配によるミドリメダカ（緑目高）^[1]
• 琥珀色に見えるコハクメダカ（琥珀目高）^[2]

• 黄色が強いクリームメダカ^[3]
• 虹色が強いサクラメダカ（桜目高）
• 上記の2種の改良種のシロメダカ^[4]（この組み合わせの親同士はこの色しか出ない。）

• 青紫色が強いムラサキメダカ（紫目高）^[5]
• 復帰突然変異による黄色が戻ったコケメダカ（苔目高）^[6]

観賞用のメダカは体型により細分化された俗称を持つ。これらは複合する場合もあり、色の次に特徴が続いて呼ばれる。

ヒカリメダカ（ホタルメダカ）系

この体系のメダカは背中がホタルの様に光るタイプであり、普通種がエラから肛門に至る光沢が当種では背中に現れている。

例：ミドリヒカリメダカ。

アルビノ系^[7]

この体系のメダカは目が赤く光るタイプであり、毛細血管が透けて見える。体色も薄く、スケルトンのような個体に多い。一方、普通種は青く光る個体が多く、ヒメダカ、シロメダカの一部にはパンダのような目をした個体もいる。

スモールアイ系

この体系のメダカは目が点の様に細く、普通種の半分位しか黒目がない以外は、他は普通種とあまり変わらない。

ダルマ系

この体系のメダカは骨格が縮んでおり、体長も普通種の半分以下しかなく、ヘルニアのような感じが強く、腹部が力士の様に出ている。

例：ムラサキダルマメダカ。

半ダルマ系^[8]

上記のダルマ系の骨格があまり縮まず、体長は普通種と比較するとあまり変わらない。

例：アオ半ダルマメダカ。

例外の組み合わせ以外は全ての色、体型はほとんど誕生する。

似た種類（アオメダカ、シロメダカ、メダカ）との飼育は可能であるが、カラーメダカとして楽しむ以外では同一の種類を飼育する事を勧める。また、体型が異なる個体同士の混泳はなるべく避けた方が良い。

ホテイアオイ等を入れて、25℃以上が続くとこれらに産卵をする。産卵をしたホテイアオイ等は親から隔離し、半月程すると稚魚が誕生する。隔離を行わないと親が卵を食べ、稚魚を飲み込む。また、稚魚は成長の程度に応じて分離する。これをしないと共食いをする場合がある。