系統樹は Johansson et al. (2008)[1]より。ただしカベバシリ科はサンプリングされていない。
キバシリ上科はヒタキ上科と姉妹群であり[1]、ヒタキ上科に含める説もある[2]。
キバシリ上科は5科に分類される。ただしカベバシリ科はゴジュウカラ科に含める説もある。キバシリ科はおそらく多系統で、ホシキバシリが別系統となっている[1]。
キバシリ上科は Sibley & Ahlquist (1990) が認めたスズメ小目の3上科にはなく、ウグイス上科に含められていた。現在のキバシリ上科はウグイス上科の基底で分岐したとされていた[3]。彼らはその群をヒタキ科（ブユムシクイ科・ミソサザイ科を含む）とゴジュウカラ科（カベバシリ科を含む）に分けたが、この科分類は系統的ではない。Cracraft (2004) によりウグイス上科からキバシリ上科が分離された。
