本亜目の分類上の位置付けは不安定であった[ 5] [ 2]
メダマウオ科の1種 Rathbunella hypoplecta メダマウオ科 Bathymasteridae [ 2] 北太平洋 の沿岸域に分布する。長い背鰭と臀鰭には棘条がなく、すべて軟条で構成され、尾鰭とは連続しない。体側面の高い位置に側線 がある。
メダマウオ属 Bathymaster
Rathbunella 属Ronquilus 属Eulophiidae イトギンポ属 のみ1属3種を含み、かつてはタウエガジ科に分類されていた。日本から韓国にかけての北太平洋に分布する。沿岸に生息し、体は非常に長い[ 2]
ゲンゲ科の1種 Bothrocara brunneum （英語版 ） ゲンゲ科の1種 Zoarces americanus （英語版 ） 汽水域 にも進出する ゲンゲ科の1種（Pachycara sp. ）。水深2,602mで撮影。本科魚類は一部を除いて利用されることがない ゲンゲ科 Zoarcidae [ 2] 北太平洋 あるいは北大西洋 に住むが、北極海 に15種、南極海 とその近海にも少なくとも21種が生息し、熱帯 ・温帯 域に分布する仲間も少数ながら知られている。
体は細長く、円筒形にやや近い。背鰭と臀鰭の基底は長く尾鰭と連続し、ほとんどの種類では棘条をもたない。口は吻 の先端か、あるいはやや下向きについている。腹鰭は小さく胸鰭の前に位置するか、ない場合もある。鱗 は小さく皮膚 に埋もれている（ハダカゲンゲ属は鱗を欠く）。浮き袋 をもたない。
アカゲンゲ属 Puzanovia
アゴゲンゲ属 Petroschmidtia
アベゲンゲ属 Japonolycodes
ウサゲンゲ属 Bilabria
ウスギヌゲンゲ属 Taranetzella
オグロゲンゲ属 Bothrocarina
オホーツクゲンゲ属 Gymnelopsis
コンニャクハダカゲンゲ属 Melanostigma
サラサガジ属 Davidijordania
シロゲンゲ属 Bothrocara
セダカゲンゲ属 Lycozoaroes
チョウジャゲンゲ属 Andriashevia
ナガガジ属 Zoarces ハダカゲンゲ属 Gymnelus
ハレガジ属 Krusensterniella
ヘビゲンゲ属 Lycenchelys
マユガジ属 Lycodes
ヤワラゲンゲ属 Lycodapus
他41属 タウエガジ科の1種 Cebidichthys violaceus タウエガジ科の1種 Lumpenus lampretaeformis タウエガジ科 Stichaeidae [ 2] 潮間帯 から水深250メートル付近にまで分布し、ほとんどの種類は北太平洋に生息する。「ギンポ」と名の付く種類が多いが、ギンポ亜目 とは異なるグループである。
長い背鰭には棘条が発達しており、鰭条のほぼすべて（時には120本以上）が棘条で構成される種類が多い。臀鰭も長いが、棘条は1 - 5本。吻（口先）から肛門 までの距離は、尾鰭と肛門の距離と同じか、あるいはより短い。多くの種類では、産卵した卵を親魚が保護する習性をもつ。
ウナギガジ属 Lumpenus
オキカズナギ属 Opisthocentrus
カズナギ属 Zoarchias
キタフサギンポ属 Soldatovia
ケムシギンポ属 Gymnoclinus
ゴマギンポ属 Stichaeopsis
タウエガジ属 Stichaeus
ダイナンギンポ属 Dictyosoma
トンガリギンポ属 Lumpenopsis
ドロギンポ属 Askoldia
ニセキタノトサカ属 Pseudalectrias
ヌイメガジ属 Acantholumpenus
ネズミギンポ属 Lumpenella
ヒメイトギンポ属 Neozoaroes
フサカケギンポ属 Bryozoichthys
フサギンポ属 Chirolophis
ムシャギンポ属 Alectrias
ムスジガジ属 Ernogrammus
ムロランギンポ属 Pholidapus
メダマギンポ属 Anisarchus
モンツキガジ属 Neolumpenus
他14属 ハダカオオカミウオ科 Cryptacanthodidae [ 2]
ハダカオオカミウオ属 Cryptacanthodes ニシキギンポ科の1種 Pholis laeta （英語版 ） ブチオオカミウオ （英語版 ） Anarhichas minor （オオカミウオ科）。大西洋沿岸では重要な漁業対象種となっているウルフイール Anarrhichthys ocellatus （英語版 ） ボウズギンポ （英語版 ） Zaprora silenus （ボウズギンポ科）。大きく明瞭な尾鰭をもつニシキギンポ科 Pholidae [ 2] 肋骨 をもたない。側線はないか、あっても短い。親魚が卵を守る習性がある。
ニシキギンポ亜科 Pholinae は1属11種。色彩に富む種類が多い。
Apodichthys 亜科 は2属4種。体色はほぼ単色である。
ハコダテギンポ属 Rhodymenichthys
Apodichthys 属Ulvicola 属オオカミウオ科 Anarhichadidae [ 2] オオカミウオ のみで、利用されることは少ないが、大西洋に分布する種類は食用魚として重要である。鱗はないか、ごく小さな円鱗に限られる。側線は発達しない。胸鰭が大きく、背鰭は棘条のみで構成される。腹鰭はなく、尾鰭も非常に小さい。顎には強靭な犬歯 と大きな臼歯 を備える。
オオカミウオ属 Anarhichas
Anarrhichthys 属ハネガジ科 Ptilichthyidae ハネガジ のみ、1属1種[ 2] 北アメリカ の太平洋沿岸に分布する。日本近海にも産するが極めて稀。体は極端に細長く、鱗がない。尾鰭と腹鰭を欠く。背鰭には丈の低い孤立した棘条が90本並び、その後ろに高い軟条が並ぶ。側線をもたない。体長は30センチメートル（cm）強と小さめだが、椎骨 の数は220個以上に及ぶ。
ボウズギンポ科 Zaproridae ボウズギンポ のみ、1属1種[ 2] 北海道 からアラスカ 、カリフォルニア にかけて分布。腹鰭と側線を欠く。背鰭の棘条は54 - 57本。体長は80 cmを超え、椎骨の数はおよそ60個である。
スキュタリナ科 Scytalinidae Scytalina cerdale のみ、1属1種[ 2]
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