当初、いくつかの義勇兵部隊、ノヴォニコラエフスク連隊等から編成され、1918年6月13日、ステップ・シベリア軍団と中シベリア軍団の2個軍団に分けられた。7月11日、ミアスクとウラル地区の歩兵及びコサック、チェリャビンスク支隊からウラル軍団が編成された。9月末には、兵員37,600人、火砲70門、機関銃184挺を数えた。
1918年10月、シベリア軍は、第1中シベリア軍団、第2ステップ・シベリア軍団、第3ウラル軍団、第4東シベリア軍団、第5沿アムール軍団に編成された。9月~10月の間、東部戦線の北西部でボリシェヴィキと戦った。12月末、ペルミを奪取し、大量の戦利品を鹵獲した。