プロトマー

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構造生物学では、プロトマー: protomer)とは、オリゴマータンパク質の構造単位である。これは、少なくとも2つの異なるタンパク質鎖で構成される最小のユニットで、このユニットの2つ以上のコピーが結合してより大きなヘテロオリゴマーを形成する。

この用語は、Na/K-ATPase酵素の命名法を明確にするために、Chetverinによって導入された[1]。この酵素は、2つのサブユニットで構成されている。大きな触媒作用を持つαサブユニットと、より小さな糖タンパク質のβサブユニット(加えてγサブユニットと呼ばれるプロテオリピド英語版)である。当時は、それぞれがどれだけの数が一緒に働いているのか不明であった。さらに、人々が二量体について語るとき、それがαβを指しているのか、(αβ)2を指しているのか、はっきりしなかった。Chetverinは、αβをプロトマー、(αβ)2をジプロトマーと呼ぶことを提案した。

プロトマーは通常、周期対称に配置され、閉じた点群対称性を形成する。

化学の分野では、プロトンの位置によって互変異性を示す分子を、いわゆるプロトマーと呼んでいる[2][3]

脚注

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