属の特徴は西川[ 1] による。学名と分類体系はWorld Register of Marine Species [ 3] に従い、有効名とされるもの、または有効な亜種名を含む種名のみを挙げた。
クビナガホシムシ属 Onchnesoma Koren & Danielssen, 1876 は、長さが体幹の10倍を超える、細長い陥入吻 を持つことが特徴。肛門はその吻上に開く。吻に繋がる筋肉である牽引筋は完全に癒合して1本になる。
Onchnesoma intermedium Murina, 1976
Onchnesoma magnibathum Cutler, 1969
Onchnesoma steenstrupii Koren & Danielssen, 1876
Onchnesoma steenstrupii nudum Cutler & Cutler, 1985
Onchnesoma steenstrupii steenstrupii Koren & Danielssen, 1876
Onchnesoma squamatum (Koren & Danielssen, 1875 )
Onchnesoma squamatum oligopapillosum Cutler, Cutler & Nishikawa, 1984
Onchnesoma squamatum squamatum (Koren & Danielssen, 1876 )
マキガイホシムシ属 Phascolion Théel, 1875 は牽引筋の癒合が不完全で、基部では数本に分かれていること、肛門が吻ではなく体幹に開くことでクビナガホシムシ属と区別できる。Isomya Cutler & Cutler, 1985 、Lesenka Gibbs, 1985 、Montuga Gibbs, 1985 、Phascolion Théel, 1875 、Villiophora Cutler & Cutler, 1985 の5つの亜属を含む。
Phascolion ( Isomya) convestitum Sluiter, 1902
Phascolion ( Isomya) gerardi Rice, 1993
Phascolion ( Isomya) hedraeum Selenka & De Man, 1883 - ツノガイホシムシ
Phascolion ( Isomya) lucifugax Selenka & de Man, 1883 - コフクロホシムシ
Phascolion ( Isomya) microspheroidis Cutler & Duffy, 1972
Phascolion ( Isomya) tuberculosum Théel, 1875
Phascolion ( Lesenka) collare Selenka & de Man, 1883
Phascolion ( Lesenka) cryptum Hendrix, 1975
Phascolion ( Lesenka) hupferi Fischer, 1894
Phascolion ( Lesenka) rectum Ikeda, 1904
Phascolion ( Lesenka) valdiviae Fischer, 1916
Phascolion ( Lesenka) valdiviae sumatrense Fischer, 1916
Phascolion ( Lesenka) valdiviae valdiviae Fischer, 1916
Phascolion ( Montuga) lutense Selenka, 1885
Phascolion ( Montuga) pacificum Murina, 1957
Phascolion ( Phascolion) abnorme Fischer, 1894
Phascolion ( Phascolion) bogorovi Murina, 1973
Phascolion ( Phascolion) caupo Hendrix, 1975
Phascolion ( Phascolion) hibridum Murina, 1981
Phascolion ( Phascolion) medusae Cutler & Cutler, 1980
Phascolion ( Phascolion) megaethi Cutler & Cutler, 1979
Phascolion ( Phascolion) pharetratum Sluiter, 1902
Phascolion ( Phascolion) psammophilus Rice, 1993
Phascolion ( Phascolion) strombus (Montagu , 1804 ) - マキガイホシムシ
Phascolion ( Phascolion) strombus cronullae Edmonds, 1980
Phascolion ( Phascolion) strombus strombus (Montagu , 1804 )
Phascolion ( Phascolion) robertsoni Stephen & Robertson, 1952
Phascolion ( Phascolion) ushakovi Murina, 1974
Phascolion ( Villiophora) cirratum Murina, 1968