ミクロ決死隊

ミクロ決死隊とは、新型ミクロナイザーによって生み出され、目に見えぬ小さな体「ミクロサイズ」になり、地球の平和を守るためミクロの世界で戦うチーム^[3]である。 彼らがミクロの世界に入った後、12時間のタイムリミットが発生する、時間を使い果たしてしまうと元の大きさに戻ってしまうのである。 本作の設定はコンセプトの一部「潜航艇を小さくする」のみ『ミクロの決死圏』と同じだが、後は全て異なる（今で言う「リブート」、但し原題は「ミクロの決死圏」と同じ " Fantastic Voyage " で、しかもミクロ化技術の研究機関の名称は原典と同じ C.M.D.F.〔Combined Miniature Defense Force , 統合縮小防衛部隊〕である）。 また、主要キャラクターの吹き替えには『ミクロの決死圏』の吹き替えにも参加した広川太一郎と鈴木弘子と大木民夫も参加している。

ブラック・アイ

声 - テッド・ナイト、吹 - 広川太一郎

オリジナルではジョナサン・キッド、CMDF の司令官。

ミスター・ネンリキ（念力、インド人という設定）

声 - マーヴィン・ミラー（英語版）、吹 - 大塚周夫

オリジナルではグル、CMDF の念力担当。日本独自のアドリブで「ねんりき」と手を動かしながら叫ぶ。

ミス・フラワー

声 - ジェーン・ウェッブ、吹 - 鈴木弘子

オリジナルではエリカ・レーン、CMDF の生物学者

学者くん

声 - マーヴィン・ミラー、吹 - 富山敬

オリジナルではバスビー・バードウェル、CMDF の科学者でロケットの開発をしているというだけでなく、このシリーズで使用される潜航艇の設計者という設定。デイリー・ビューグルの新聞を読んでいる時がある^[4]。

X(エックス)

声 - 吹 - 大木民夫

CMDF のボス、指令担当

教授

声 - 吹 - 川久保潔

カバラ

声 - 吹 - 熊倉一雄

水晶で呪いを起こす悪者

ナレーション

声 - テッド・ナイト、吹 - 矢島正明