佐世保海上保安部

長崎県北西部（壱岐・対馬付近を除く）を担任水域としている。担任水域内には、海上空港である長崎空港があるため、皇族・外国要人の訪問時等には警護、海上警備を実施する^[1]。

また、佐世保港には、佐世保基地があり、原子力艦船が入港する際（入港時でない場合も通常の放射線測定を1ヶ月に数回行っている）には、放射線測定を実施する^[1]。