兵庫県の二級水系一覧
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兵庫県の二級水系一覧では、兵庫県を流れる水系のうち、兵庫県が管理する二級水系を記述する。2004年4月1日現在、92水系、350河川ある。
リストの順序は、河口の位置を基準に、瀬戸内海沿岸を大阪府境から西へ、日本海沿岸を京都府境から西へ、淡路島の河川を島の北端から時計回り、の順番に並んでいる。地形順の参考として一級水系（国土交通省管轄）も記載している。括弧内の水系名が一級水系。
| 水系名 | 流路延長(km) | 流域面積(km2) | 河川数 | 河口のある自治体 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 蓬川 | 2.416 | 1 | 尼崎市 | よもがわ | |
| 武庫川 | 65.709 | 46 | 尼崎市、西宮市 | ||
| 新川 | 2.381 | 1 | 西宮市 | ||
| 東川 | 5.289 | 2 | 西宮市 | ||
| 洗戎川 | 1.855 | 1 | 西宮市 | あらいえびすがわ | |
| 夙川 | 4.125 | 1 | 西宮市 | しゅくがわ | |
| 堀切川 | 0.812 | 1 | 西宮市 | ||
| 宮川 | 3.070 | 1 | 芦屋市 | ||
| 芦屋川 | 4.542 | 1 | 芦屋市 | ||
| 高橋川 | 1.410 | 3 | 神戸市東灘区 | ||
| 天上川 | 2.509 | 2 | 神戸市東灘区 | ||
| 住吉川 | 3.600 | 2 | 神戸市東灘区 | ||
| 西獺川 | 2.460 | 1 | 神戸市東灘区 | にしうそがわ | |
| 天神川 | 2.875 | 1 | 神戸市東灘区 | ||
| 石屋川 | 2.682 | 2 | 神戸市東灘区 | ||
| 高羽川 | 2.035 | 1 | 神戸市東灘区 | ||
| 都賀川 | 1.790 | 3 | 神戸市灘区 | ||
| 西郷川 | 2.322 | 4 | 神戸市灘区 | ||
| 西谷川 | 2.520 | 1 | 神戸市中央区 | ||
| 生田川 | 1.790 | 7 | 神戸市中央区 | ||
| 鯉川 | 1.725 | 3 | 神戸市中央区 | ||
| 宇治川 | 2.265 | 2 | 神戸市中央区 | ||
| 新湊川 | 4.665 | 5 | 神戸市長田区 | ||
| 妙法寺川 | 6.975 | 3 | 神戸市須磨区 | ||
| 千森川 | 1.925 | 2 | 神戸市須磨区 | ||
| 一の谷川 | 0.690 | 1 | 神戸市須磨区 | ||
| 塩屋谷川 | 3.460 | 2 | 神戸市垂水区 | ||
| 福田川 | 7.410 | 2 | 神戸市垂水区 | ||
| 山田川 | 3.835 | 1 | 神戸市垂水区 | ||
| 朝霧川 | 2.690 | 1 | 明石市 | ||
| 明石川 | 20.985 | 6 | 明石市 | ||
| 谷八木川 | 3.505 | 1 | 明石市 | ||
| 赤根川 | 4.305 | 1 | 明石市 | ||
| 瀬戸川 | 4.110 | 2 | 明石市 | ||
| 喜瀬川 | 8.380 | 1 | 播磨町 | ||
| 泊川 | 1.420 | 1 | 加古川市 | ||
| （加古川） | 96.000 | 1730 | 130 | 加古川市、高砂市 | 一級水系 |
| 法華山谷川 | 15.947 | 2 | 加西市、加古川市、 高砂市 | ほっけさんたにがわ | |
| 天川 | 18.720 | 2 | 高砂市、姫路市 | ||
| 西浜川 | 1.941 | 1 | 姫路市 | ||
| 八家川 | 4.480 | 1 | 姫路市 | やかがわ | |
| 市川 | 77.554 | 26 | 姫路市 | いちかわ | |
| 野田川 | 3.635 | 2 | 姫路市 | ||
| 船場川 | 11.572 | 2 | 姫路市 | ||
| 夢前川 | 39.667 | 9 | 姫路市 | ゆめさきがわ | |
| 汐入川 | 3.380 | 1 | 姫路市 | ||
| 大津茂川 | 18.608 | 4 | 太子町、 姫路市 | ||
| （揖保川） | 70.000 | 810 | 47 | 姫路市 | 一級水系 |
| 富島川 | 2.295 | 2 | たつの市 | ||
| 亀の尾川 | 0.977 | 1 | 相生市 | ||
| 大谷川 | 1.348 | 1 | 相生市 | ||
| 苧谷川 | 4.455 | 5 | 相生市 | おこくがわ | |
| 佐方川 | 1.715 | 2 | 相生市 | ||
| 千種川 | 72.155 | 57 | 赤穂市 | ||
| 大津川 | 6.735 | 7 | 赤穂市 | ||
| （円山川） | 68.000 | 1300 | 97 | 豊岡市 | 一級水系 |
| 竹野川 | 21.218 | 8 | 豊岡市 | ||
| 須井川 | 2.300 | 1 | 豊岡市 | ||
| 安木川 | 1.900 | 1 | 香美町 | ||
| 佐津川 | 13.509 | 2 | 香美町 | ||
| 上計川 | 1.500 | 1 | 香美町 | あげがわ | |
| 香住谷川 | 2.109 | 1 | 香美町 | ||
| 矢田川 | 34.691 | 13 | 香美町 | ||
| 長谷川 | 1.745 | 1 | 香美町 | ||
| 西川 | 1.700 | 1 | 香美町 | ||
| 岸田川 | 23.852 | 15 | 新温泉町 | ||
| 大栃川 | 2.291 | 1 | 新温泉町 | ||
| 結川 | 2.150 | 1 | 新温泉町 | むすぶがわ | |
| 長谷川 | 0.373 | 1 | 淡路市 | ||
| 茶間川 | 1.800 | 1 | 淡路市 | ||
| 楠本川 | 3.600 | 1 | 淡路市 | ||
| 浦川 | 4.549 | 1 | 淡路市 | ||
| 砂川 | 0.600 | 1 | 淡路市 | ||
| 老松川 | 0.400 | 1 | 淡路市 | ||
| 佐野川 | 2.500 | 1 | 淡路市 | ||
| 生穂川 | 3.150 | 1 | 淡路市 | ||
| 大谷川 | 1.560 | 1 | 淡路市 | ||
| 志築川 | 2.200 | 2 | 淡路市 | ||
| 岩戸川 | 4.960 | 1 | 洲本市 | ||
| 洲本川 | 8.084 | 9 | 洲本市 | ||
| 天川 | 1.690 | 1 | 洲本市 | ||
| 本庄川 | 6.850 | 3 | 南あわじ市 | ||
| 塩屋川 | 5.250 | 1 | 南あわじ市 | ||
| 津井川 | 5.700 | 1 | 南あわじ市 | ||
| 三原川 | 11.127 | 20 | 南あわじ市 | ||
| 鳥飼川 | 4.749 | 4 | 洲本市 | ||
| 都志川 | 8.536 | 3 | 洲本市 | ||
| 山田川 | 4.000 | 1 | 淡路市 | ||
| 覗川 | 1.000 | 1 | 淡路市 | のぞきがわ | |
| 郡家川 | 15.927 | 1 | 淡路市 | ||
| 新川 | 3.790 | 1 | 淡路市 | ||
| 室津川 | 2.240 | 2 | 淡路市 | ||
| 育波川 | 2.509 | 1 | 淡路市 | ||
| 富島川 | 1.910 | 1 | 淡路市 | ||
| 野島川 | 3.755 | 1 | 淡路市 |
