阿古屋野丘陵の下を潜り抜けるトンネルである[2]。1989年(平成元年)9月27日に佐藤工業、桜井建設共同企業体と契約し、同年9月28日から1992年(平成4年)6月30日の工期にて着工した[3]。1990年(平成2年)11月30日には当初予定より早くトンネルが貫通し[4]、1992年(平成4年)11月24日に完工、開通式が執り行われた。総事業費は約15億3,000万円[2]。
トンネルの名称は、当初吾妻野台地を通過するルートであったことから、『吾妻トンネル』と呼称していたが、黒部市からの強い要望と阿古屋野台地を掘り抜くことから、1989年度から阿古屋野トンネルに改名している[5]。
始点および終点の両坑門には、黒部市の名水の里をイメージしたタイルモザイクが施されている[4]。