Archaeoglobaceae

Auch wenn sie alle phylogenetisch miteinander verwandt sind, unterscheiden sich die Gattungen der Archaeoglobaceae in Einzelheiten ihres Stoffwechsels. Die Archaeen der Gattung Archaeoglobus sind chemoorganotrophe und sulfatreduzierend. Sie sind die einzigen bekannten Vertreter der Archaeen, die über diese Art des Stoffwechsels verfügen (Stand 2005). Die Mitglieder der Gattung Ferroglobus sind hingegen chemolithotrophe Organismen und verbinden die Oxidation von Eisen mit der Reduktion von Nitrat. Die Vertreter der Gattung Geoglobus sind eisenreduzierende Archaeen, die Wasserstoffgas oder organische Verbindungen als Energiequelle nutzen.^[4]

Die hier angegebene Taxonomie basiert auf folgenden Quellen:

• (L) – List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)^[2]
• (N) – National Center for Biotechnology Information (NCBI)^[1]
• (G) – Genome Taxonomy Database (GTDB).^[3]

Die unter Einbeziehung von Metagenomik-Daten erstellte GTDB teilt etliche der Gattungen und Spezies aus der herkömmlichen Systematik auf.

Referenzstämme sind durch ein hochgestelltes T (ᵀ – englisch type) gekennzeichnet, die Typ-Taxa sind fett wiedergegeben. Stand: Anfang März 2023.

Klasse Archaeoglobi Garrity & Holt 2002^(G,L,N)

• Ordnung Archaeoglobales Huber & Stetter 2002^(G,L,N)
  • Familie Archaeoglobaceae Huber & Stetter 2002^(G,L,N)
    • Gattung Archaeoglobus Stetter 1988^(G,L,N)

      In der GTDB sind einige der zugehörigen Arten abgespaltet und in neuen Gattungen mit den provisorischen Bezeichnungen Archaeoglobus_A, Archaeoglobus_B und Archaeoglobus_C untergebracht.^(G)

    • Gattung Ferroglobus Hafenbradl et al. 1997^(L,G,N)
      • Spezies Ferroglobus placidus Hafenbradl et al. 1997^(L,G,N)
        • Stamm AEDII12DOᵀ^(L,N) alias DSM:10642ᵀ^(L,G,N)
          – Fundort: Italien, Hydrothermalfeld vor Insel Vulcano^(N)
      • Spezies Ferroglobus sp015520115^(G) [Ferroglobus sp. isolate S146_9^(N)]
        • Stamm S146_9ᵀ^(G,N)
          – Fundort: Pazifik, Brothers Volcano^[5]
    • Gattung Geoglobus Kashefi et al. 2002^(L,G,N)
    • Gattung „Candidatus Methanomixotrophus“ corrig. Liu et al. 2020^(L) [„Ca. Methanomixophus“ Liu et al. 2020^(L)]
      • Spezies „Ca. Methanomixotrophus dualis“ corrig. Liu et al. 2020^(L) [„Ca. Methanomixophus dualitatem“ Liu et al. 2020^(L)]
        • Stamm WYZ-LMO1ᵀ alias LMO1ᵀ^(L)
        • Stamm [WYZ-]LMO3 alias LM03^[6][7]
          – Fundort: Yellowstone-Nationalpark, Washburn Hot Springs^[8][9] (bzw. Obsidian Pool)^[6]
      • Spezies „Ca. Methanomixotrophus hydrogenitrophicus“ corrig. Liu et al. 2020^(L) [„Ca. Methanomixotrophus hydrogenitrophicum“ Liu et al. 2020^(L)]
        • Stamm in16ᵀ^[6]
          – Fundort: China, Jiangsu Erdölreservoir^[6]
    • Gattung „Candidatus Methanoproducendum“ Hua et al. 2019^[10]
      • Spezies „Ca. Methanoproducendum senex“ Hua et al. 2019
        • Stamm GMQP bin_32ᵀ^[10]
          – Fundort: China, Tengchong, Heiße Quelle GuMingQuan^[10]
    • Gattung JdFR-37^(G)
      • Spezies JdFR-37 sp002010215^(G) [Archaeoglobus sp. JdFR-37^(N)]
        • Stamm JdFR-37ᵀ^(G,N)
          – Fundort: Pazifik, Fluide der basaltischen Kruste^(N)(N) am Juan-de-Fuca-Rücken (JdFR)
  • Familie JdFR-42^(G)
    • Gattung JdFR-42^(G)
      • Spezies JdFR-42 sp002010305^(G) [Archaeoglobi archaeon JdFR-42^(N)]
        • Stamm JdFR-42ᵀ^(G,N)
          – Fundort: Pazifik, Fluide in der basaltischen Flanke des Juan-de-Fuca-Rückens^(N) (JdFR)
  • Mitglieder der Ordnung Archaeoglobales incertae sedis

    • Spezies Archaeoglobales archaeon ex4484_92^(N)
      • Stamm ex4484_92ᵀ^(G,N) (GTDB:Failed Quality Check)
        – Fundort: Golf von Kalifornien, Guaymas Basin^(N)

• Ordnung JdFR-21^(G)
  • Familie JdFR-21^(G)
    • Gattung JdFR-21^(G)
      • Spezies JdFR-21 sp002011165^(G) [Euryarchaeota archaeon JdFR-21^(N)]
        • Stamm JdFR-21ᵀ^(G,N)
          – Fundort: Pazifik, Bodenfluide des Juan-de-Fuca-Rückens^(N) (JdFR)

• Mitglieder der Klasse Archaeoglobi incertae sedis

  • Spezies Archaeoglobi archaeon isolate WYZ-LMO2^(N)
    • Stamm WYZ-LMO2^(N)[11]

Anmerkungen:

※ – „Archaeoglobus species-group 2“

In eckigen Klammern ist vermerkt, in welchen Gattungen sich die Archaeoglobus-Arten nach dem in der GTDB vorgenommenen Split wiederfinden.

1. [1]

   Die 16S-rRNA-Daten legen eine Zugehörigkeit von Archaeoglobus infectus zur Gattung mit der provisorischen Bezeichnung Archaeoglobus_A nahe, um Monophylie zu gewährleisten.

Wikispecies: Archaeoglobaceae – Artenverzeichnis

• Sayers, Schoch et al.: Archaeoglobaceae. National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database, abgerufen am 5. Juni 2021 (englisch).
• Galina Slobodkina, Maxime Allioux, Alexander Merkel, Marie-Anne Cambon-Bonavita, Karine Alain, Mohamed Jebbar, Alexander Slobodkin: Physiological and Genomic Characterization of a Hyperthermophilic Archaeon Archaeoglobus neptunius sp. nov. Isolated From a Deep-Sea Hydrothermal Vent Warrants the Reclassification of the Genus. In: Frontiers in Microbiology, Sektion Extreme Microbiology, Band 12; 16. Juli 2021; doi:10.3389/fmicb.2021.679245, ResearchGate:353294464 (englisch).
• Archaeoglobaceae, auf: Species2000
• MicrobeWiki: Suche: Archaeoglobaceae. Kenyon College, Department of Biology
• J. P. Euzéby: Archaeoglobaceae. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), abgerufen am 17. November 2021.
• Archaeoglobaceae, auf Lifemap NCBI Version
• Archaeoglobi, auf OneZoom
• Archaeoglobaceae, auf LifeGate