Phaeovirus
Gattung der Familie Phycodnaviridae
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Phaeovirus ist eine Gattung von Viren in der Familie der Phycodnaviridae und gehört damit zum Phylum Nucleocytoviricota (alias Nucleocytoplasmic large DNA viruses, NCLDV).[1] Als natürliche Wirte dienen Algen der Ordnung Ectocarpales. Es gibt (mit Stand 30. April 2024) drei Spezies in dieser Gattung.[2][3] Der Wortbestandteil Phaeo- ist abgeleitet von griechisch φαιός phaiós: „dunkel“.
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Schemazeichnung: Virion der Gattung Phaeovirus, typisch für die Familie Phycodnaviridae | ||||||||||||||||
| Systematik | ||||||||||||||||
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| Taxonomische Merkmale | ||||||||||||||||
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| Wissenschaftlicher Name | ||||||||||||||||
| Phaeovirus | ||||||||||||||||
| Links | ||||||||||||||||
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Systematik
Innere Systematik
Das International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) hat mit Stand 30. April 2024 folgende Spezies anerkannt:[2][4]
Gattung Phaeovirus
- Spezies Phaeovirus feldmanniae mit
- Feldmannia species virus (FLSV, FsV, FspV, Wirt Feldmannia sp., Ectocarpales: Acinetosporaceae)[5][6]
- Spezies Phaeovirus irregularis mit
- Feldmannia irregularis virus a (FirrV-a, auch FirrV-1)
- Spezies Phaeovirus unasiliculosus mit
- Ectocarpus siliculosus virus 1 (EsV-1, ehem. Typusspezies, Wirt Ectocarpus siliculosus, Ectocarpales: Ectocarpaceae[7])
Nicht mehr offiziell geführt werden folgende Vertreter:
- Spezies „Ectocarpus siliculosus virus a“ (EsV-a, auch EsV-1a, Wirt Ectocarpus siliculosus, Ectocarpales: Ectocarpaceae[7])
- Spezies „Ectocarpus fasciculatus virus a“ (EfV-a, Wirt Ectocarpus fasciculatus)
- Spezies „Feldmannia species virus a“ (FsV-a)
- Spezies „Hincksia hinckiae virus a“ (HhV-a, auch HhV-1, Wirt Hincksia hinckiae, Ectocarpales: Acinetosporaceae)
- Spezies Myriotrichia clavaeformis virus a (McV-a, auch McV-1, Wirt Myriotrichia clavaeformis, Ectocarpales: Chordariaceae)
- Spezies „Pilayella littoralis virus 1“ (PlV-1, Wirt Pylaiella littoralis — sic! siehe WoRMS[8] und AlgaeBase,[9] Ectocarpales: Acinetosporaceae)
Eine Liste, die auch einzelne Stämme (Isolate) und Abkürzungen aufführt findet man bei ScienceDirect.[10] Oft – nicht immer – bezeichnet der Zusatz -a eine Spezies, -1 den zugehörigen Typus-Stamm (Isolat).
Äußere Systematik
Die folgende Systematik folgt Schulz et al. (2018) mit Korrekturen und Ergänzungen nach Hao et al. (2018):[11][12]
| Phycodnaviridae |
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YSLPV = „Yellowstone Lake Phycodnavirus“
DSLPV = „Dishui Lake Phycodnavirus“
Greiner et al. (2018) sehen YLPV2 (alias YSLPV2, Yellowstone Phycodnavirus 2) jedoch nicht in der Klade der Viren vom Chlorovirus-Typ.[15]
Aufbau
Die Virionen (Virusteilchen) der Phaeoviren haben eine Hülle mit ikosaedrischer oder sphärischer Geometrie mit der Triangulationszahl T=169. Der Durchmesser beträgt ca. 120–150 nm.
Genom
Das Genom ist linear und hat eine Länge von etwa 150–350 Kbp (Kilobasenpaaren).[3]
Bei der Typusspezies EsV-1 haben die Virionen einen Durchmesser von 200 nm, die Genomlänge beträgt 335.593 bp, es werden vorhergesagt 240 Proteine kodiert und der GC-Gehalt liegt bei 51,7 %.[16][17]
Vermehrungszyklus
Die Virusreplikation geschieht nukleo-cytoplasmatisch (vom Zellkern ins Zytoplasma). Das Virus verlässt die Wirtszelle durch Lyse vermittels lytischer Phospholipide. Die Übertragung geschieht durch passive Diffusion.[3]
Literatur
- Dickson Kinyanyi, George Obiero, Peris W Amwayi, Stephen Mwaniki, Mark Wamalwa: In silico structural and functional prediction of African swine fever virus protein-B263R reveals features of a TATA-binding protein. In: PeerJ, Band 6, Nr. 4, S. e4396, 2018; doi:10.7717/peerj.4396, ResearchGate:323344287 (englisch). Siehe S. 13, insbes. Fig. 7.
- Weijia Zhang, Jinglie Zhou, Taigang Liu, Yongxin Yu, Yingjie Pan, Shuling Yan, Yongjie Wang: Four novel algal virus genomes discovered from Yellowstone Lake metagenomes. In: Scientific Reports, Band 5, Artikel Nr. 15131, 13. Oktober 2015; doi:10.1038/srep15131 (englisch).