En 1908, tras recibir la aprobación, un gran número de antigüedades de plata del patriarca Cirilo V y donaciones públicas, Marcus Simaika Pasha construyó el Museo Copto y lo inauguró el 14 de marzo de 1910.[2] La comunidad copa fue generosa con su apoyo al museo, donando vestimenta, frescos e iconos. En 1931 el Museo Copto se convirtió en un museo estatal, bajo la jurisdicción del Departamento de Antigüedades y en 1939 el Museo Egipcio trasladó su colección de antigüedades cristianas aquí.[3] Fueron albergados en la Nueva Ala, completada en 1944. Debido a los daños sufridos, la Ala Antigua cerró en 1966 y el museo entero fue renovado entre 1983 y 1984. Los cimientos del museo se reforzaron entre 1986 y 1988, lo que ayudaron a que el museo sobreviviera tras el terremoto de 1992.[2] Entre 2005 y 2006 se produjeron nuevas restauraciones.[4]
Marcus Simaika Pasha fue sucedido por Togo Mina y más tarde Pahor Labib, el primero en obtener el título de director del Museo Copto. Además del edificio del museo, hay jardines y patios y la zona está rodeada por antiguas iglesias coptas. Hay seis iglesias, algunas de las cuales tienen sus orígenes tan pronto como en el siglo V, incluyendo la iglesia Colgante y la iglesia de los santos Sergio y Baco.[5]
Contiene diferentes piezas de arquitectura, objetos de marfil, iconos y papiros todos ellos de factura copta. Se encuentran en el museo los célebres Manuscritos de Nag Hammadi.[6]
A raíz de la pandemia por COVID-19, este museo, junto con otros museos y yacimientos de Egipto, a iniciativa del Ministerio de Antigüedades y Turismo,[7] crearon una visita virtual por sus instalaciones y piezas.[8]
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