Viroma humano
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El viroma humano es la colección total de virus en y sobre el cuerpo humano.[3][4][5] Los virus en el cuerpo humano pueden infectar tanto las células humanas como otros microbios, como las bacterias (bacteriófagos).[6] Algunos virus causan enfermedades, mientras que otros pueden ser asintomáticos. Ciertos virus también se integran en el genoma humano como provirus o elementos virales endógenos.
Los virus evolucionan rápidamente y, por lo tanto, el viroma humano cambia constantemente.[7] Cada ser humano tiene un viroma único con un equilibrio único de especies.[4][8] El estilo de vida, la edad, la ubicación geográfica e incluso la estación del año pueden afectar la exposición de un individuo a los virus, y la susceptibilidad de uno a cualquier enfermedad que pueda ser causada por esos virus también se ve afectada por la inmunidad preexistente y la genética viral y humana.[9]
El viroma humano está lejos de estar completamente explorado y con frecuencia se descubren nuevos virus. A diferencia de los aproximadamente 40 billones de bacterias en un microbioma humano típico,[10] todavía no se dispone de una estimación del número de partículas virales en un humano adulto sano, aunque los viriones generalmente superan en número a las bacterias individuales 10:1 en la naturaleza. El estudio del viroma se cree que proporcionará una comprensión de los microbios en general y cómo afectan la salud y la enfermedad humana.
Hay varios métodos disponibles para el aislamiento y el estudio de virus humanos:
- La secuenciación profunda es una técnica de secuenciación rápida de ADN que es útil para caracterizar la riqueza del viroma, la estabilidad, la función del gen y la asociación con fenotipos de enfermedades.[3][5] Esta tecnología crea grandes cantidades de información de secuencia y es capaz de detectar componentes raros de una comunidad microbiana. Los métodos actuales que combinan la eliminación de ADN humano y bacteriano de las muestras, la secuenciación a gran escala y la bioinformática son muy eficientes en la identificación de virus desconocidos.[11] A diferencia de otros métodos de descubrimiento, los virus no necesitan crecer en cultivos celulares. Sin ningún conocimiento previo de la secuencia del genoma o los métodos de crecimiento, se pueden descubrir nuevos virus. Por lo tanto, la secuenciación profunda es adecuada para la identificación rápida de un virus desconocido o inesperado involucrado en un brote de enfermedad o asociado con afecciones que no se consideran causadas por virus. La secuenciación profunda también permite proyecciones a gran escala con un mínimo esfuerzo práctico.[12] Una exploración sistemática de los virus que infectan a los humanos (el viroma humano) es importante y factible con estos métodos.
- La reacción en cadena de la polimerasa es una herramienta para amplificar y detectar secuencias de ADN específicas. Se puede usar para ayudar a caracterizar el viroma, pero está limitado por la necesidad de información de secuencia de ADN al menos parcial.
- El metagenoma humano incluye todos los organismos que viven en nosotros. Los virus contribuyen al metagenoma y establecen una infección crónica que infesta los cromosomas; Este método formulará una nueva estimación del número de genes que confieren susceptibilidad a un virus determinado y especificará alelos para algunos virus.[13][14]
- Los estudios de anticuerpos a gran escala con ELISA usando sangre donada podrían ayudar a determinar la exposición humana a virus particulares en diferentes regiones geográficas.[9]
