Il fait partie d'une dynastie municipale nantaise, puisque son père, Guillaume, deux de ses fils, Louis et Jean, et un de ses gendres, Pierre Bernard, ont aussi été maires de Nantes.
Maire de Nantes, premier mandat (1588-1589)
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Docteur en droit, il devient, à la suite de son père, greffier en chef au parlement de Bretagne, puis conseiller au parlement entre 1573 et 1580, puis sénéchal de Nantes de 1583 à 1587, conseiller du Roi et président du présidial de Nantes[3].
Il est élu le et installé le . Il est réélu le . Le sous-maire est Jean Fourché (maire en 1597-1598).
Le mandat de Charles Harouys se situe dans une période politique troublée, celle de la radicalisation du conflit entre la Ligue et le pouvoir royal, avec l'assassinat du duc de Guise (1588) et la perspective de l'avènement du protestant Henri de Navarre.
Le duc de Mercœur, un des chefs du parti catholique, est gouverneur de Bretagne depuis 1582, installé au château de Nantes. Très indépendant vis-à-vis du pouvoir royal, il entre en sécession ouverte durant l'année 1589[n. 2], avec le soutien de la masse de la population de Nantes.
L'arrestation et l'incarcération de Charles Harouys (1589-1591)
Il se trouve en position délicate, étant sur des positions loyalistes.
Le , il est arrêté par des hommes du duc de Mercœur et incarcéré dans la prison du château.
Il reste deux ans en prison; il est libéré après paiement d’une somme de 3 000 écus. Durant cette période, ses biens ont subi des atteintes graves, évaluées par la suite à 8000 écus, qu’un jugement condamnera la ville de Nantes et la famille Mercœur à lui rembourser. En 1619, Louis XIII demandera aux États de Bretagne de payer 3 000 écus à sa famille en récompense de son dévouement à la cause royale[4].
Maire de Nantes : second mandat (1598-1599)
Nantes est la dernière grande ville ligueuse à reconnaître l'autorité d'Henri IV. C'est donc là que s'achève la dernière campagne militaire des guerres de religion, avec la reddition de la ville, négociée par Jean Fourché, et la signature de l'édit de Nantes (fin ).
À l'occasion de son séjour à Nantes, le roi établit une nouvelle procédure pour la mairie de Nantes: il choisira le maire dans une liste de trois personnes et les 6 échevins dans une liste de 18 personnes, le changement étant fixé au 1ermai.
Une assemblée des principaux notables a lieu le . Les trois candidats proposés au roi sont: Charles Harouys (à l’unanimité), le procureur du roi, de la Bouexière, et le sénéchal de Nantes. Le 27, Henri IV désigne Charles Harouys comme maire; ce dernier entre en fonctions le . Le sous-maire est Pierre Blanchet, conseiller au présidial; le procureur syndic: Guillaume Dachon; le miseur: Jacques Merceron.
Postérité
Il se marie avec Françoise de Lesrat, dame du Bourgnouveau, fille de Guillaume de Lesrat, maire d’Angers (1547), veuve de Guillaume Le Maire, sénéchal de Nantes. De ce mariage, naîtront 4 enfants:
Toujours à Carquefou, on lui attribue également la construction de l'actuel château de l'Épinay (ou Lespinay) (architecte: François Mansart), généralement daté de 1650[n. 4].
En 1687, il est emprisonné pour dilapidation dans sa charge de trésorier, sans malversations. Il semblerait que le montant des sommes en jeu ait été de 5 millions de livres[6].
↑ Chronologie à préciser, mais de toute façon, Henri III n'était plus considéré comme un soutien du parti catholique, d'où son assassinat en août 1589.
↑ Le nom "Delahaye", sans prénom, "architecte parisien", se trouve sur plusieurs sites en relation avec le château de la Seilleraye. Une première approche sur Internet n'en fournit pas d'autres attestations.
↑ Chronologie à mettre au point. Cf. site Infobretagne Carquefou, pas très clair sur ce point.
Alexandre Perthui et Stéphane de La Nicollière-Teijeiro, Le livre doré de l’hôtel de ville de Nantes, t.I, Imprimerie Grinsard, , p.177-179 et 191-193 (Charles Harouys); 231-233 (Louis); 234-236 (Jean)
Le Patrimoine des communes de Loire-Atlantique, t.1, Charenton-le-Pont, Flohic éditions, , p.214-215 (Carquefou)