Ayant obtenu le diplôme de composition à Tokyo[2] puis 7 prix du Conservatoire de Paris, Kanako Abe mène d'abord une carrière de pianiste. Son disque consacré aux œuvres pour piano solo de Toru Takemitsu (2002) a été particulièrement salué par la critique.
Elle fait ensuite ses débuts en tant que cheffe d'orchestre en 2003. En 2005, elle fonde l'Ensemble Multilatérale, un ensemble de musique contemporaine dont elle a été directrice musicale[3] jusqu'en 2014.
Elle a assuré plus de 200 créations mondiales[4], en étroite collaboration avec plusieurs compositeurs, notamment Martin Matalon, Michaël Lévinas. Sa discographie comporte quatre disques monographiques de Régis Campo (1999, 2002, 2005[5], 2014).
Kanako Abe est présidente du CSJP (Comité des Concerts de charité pour les sinistrés du séisme au Japon à Paris). En avril et en puis en , elle a organisé et a dirigé des concerts de charité à l'UNESCO sous le haut patronage de l'Ambassade du Japon.
Depuis 2013, Kanako Abe est présidente de l'Association franco-japonaise de la musique contemporaine[8].
En 2014, Kanako Abe a été nommée Directrice Musicale de l'Indonesian Youth Symphony Orchestra (IYSO)[9], ainsi que Directrice Artistique de Musica Universalis[10]. En 2015, elle a été nommée Music Partner de Tokyo Ensemnable Factory[11].
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