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NLRC4

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PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
記号NLRC4, CARD12, CLAN, CLAN1, CLANA, CLANB, CLANC, CLAND, CLR2.1, IPAF, AIFEC, FCAS4, NLR family, CARD domain containing 4, NLR family CARD domain containing 4
NLRC4
PDBに登録されている構造
PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧

4KXF

識別子
記号NLRC4, CARD12, CLAN, CLAN1, CLANA, CLANB, CLANC, CLAND, CLR2.1, IPAF, AIFEC, FCAS4, NLR family, CARD domain containing 4, NLR family CARD domain containing 4
外部IDOMIM: 606831 MGI: 3036243 HomoloGene: 10924 GeneCards: NLRC4
遺伝子の位置 (ヒト)
2番染色体 (ヒト)
染色体2番染色体 (ヒト)[1]
2番染色体 (ヒト)
NLRC4遺伝子の位置
NLRC4遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点32,224,453 bp[1]
終点32,265,732 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
17番染色体 (マウス)
染色体17番染色体 (マウス)[2]
17番染色体 (マウス)
NLRC4遺伝子の位置
NLRC4遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点74,732,433 bp[2]
終点74,766,137 bp[2]
遺伝子オントロジー
分子機能• ヌクレオチド結合
• protein homodimerization activity
• ubiquitin-protein transferase activity
• 血漿タンパク結合
• ATP binding
• magnesium ion binding
• cysteine-type endopeptidase inhibitor activity involved in apoptotic process
• identical protein binding
細胞の構成要素• 細胞質
• 細胞質基質
• 細胞内
• IPAF inflammasome complex
• 細胞核
生物学的プロセス• ピロトーシス
• inhibition of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
• 免疫系プロセス
• regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
• mitotic spindle assembly
• regulation of signal transduction
• defense response to bacterium
• positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity
• detection of bacterium
• activation of innate immune response
• positive regulation of apoptotic process
• 炎症反応
• protein homooligomerization
• activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
• アポトーシス
• protein ubiquitination
• regulation of apoptotic process
• 自然免疫
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
種ヒトマウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)

NM_001199138
NM_001199139
NM_001302504
NM_021209

NM_001033367

RefSeq
(タンパク質)

NP_001186067
NP_001186068
NP_001289433
NP_067032

NP_001028539

場所
(UCSC)
Chr 2: 32.22 – 32.27 MbChr 2: 74.73 – 74.77 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス

NLRC4(NLR family CARD domain containing 4)は、ヒトではNLRC遺伝子によってコードされているタンパク質である[5][6]。

NLRC4タンパク質は、哺乳類の間で高度に保存されている。C. elegansのCED-4タンパク質との相同性を有し、N末端のCARD(英語版)ドメイン、中央部のヌクレオチド結合/NACHTドメイン(英語版)、C末端のロイシンリッチリピート(LRR)ドメインから構成される。このタンパク質はNLRファミリーに属し、このファミリーには転写コアクチベーターCIITA(英語版)や古典的インフラマソームタンパク質NLRP3が含まれている。マウスの切り詰められたNLRC4タンパク質は、このファミリーのメンバーの中で最初に結晶構造が解かれた[7]。

NLRC4はインフラマソーム形成の開始と関連している。NLRP3とは異なり、NLRC4のインフラマソーム依存的機能は足場タンパク質ASC(英語版)非依存的に発揮される可能性がある[8]。NLRC4はフラジェリンやIII型分泌装置の構成要素の認識によって活性化され、カスパーゼ-1依存的にパイロトーシスを誘導する[9]。

相互作用

NLRC4はNAIP(英語版)と相互作用することが示されている。ヒトではNAIPは1種類しか存在しないが、マウスは少なくとも4種類のNAIPタンパク質を発現している。NAIP/NLRC4間の相互作用によって、NLRC4の活性化の際のリガンド特異性が決定されている可能性がある[10]。NLRC4依存的インフラマソーム活性はカスパーゼ-1を活性化する。特定の条件下では、NLRC4とNLRP3が同一のインフラソーム複合体中に存在している可能性がある[11]。

臨床的意義

出典

関連文献

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