PTPN11

SHP2は、パラログであるSHP1（PTPN6（英語版））と同じく、N末端の2つのタンデムなSH2ドメインにPTPドメインが続くというドメイン構造をしている。不活性状態では、N末端のSH2ドメインがPTPドメインに結合して基質が活性部位へアクセスすることを防いでおり、自己阻害状態となっている。標的のリン酸化チロシン残基への結合に伴ってN末端のSH2ドメインはPTPドメインから解離し、自己阻害状態を解除することによって酵素を活性化する。

PTPN11遺伝子座のミスセンス変異はヌーナン症候群とLEOPARD症候群の双方と関係している。

また、メタコンドロマトーシスとも関係している^[8]。

ヌーナン症候群を引き起こすPTPN11の変異の一部では、若年性骨髄単球性白血病の高い発病率も観察される。SHP2の活性化型変異は、神経芽細胞腫、悪性黒色腫、急性骨髄性白血病、乳がん、肺がん、大腸がんでも検出されている^[11]。近年では、NPM1変異型の急性骨髄性白血病患者のコホート研究において、比較的高いPTPN11変異の保有率（24%）がみられることが次世代シーケンシングによって検出されている^[12]。しかし、こうした関係が予後に与える重要性は明確にはされていない。こうしたデータはSHP2ががん原遺伝子である可能性を示唆している。一方で、PTPN11/SHP2が腫瘍形成の促進因子と抑制因子のいずれとしても作用しうることが報告されている^[13]。老齢マウスモデルでは、肝細胞特異的なPTPN11/SHP2の欠失はSTAT3経路を介した炎症性シグナル伝達と肝細胞の炎症/壊死を促進し、結節性再生性過形成（英語版）と腫瘍形成を引き起こす。また、ヒトの肝細胞がん試料の一部ではPTPN11/SHP2の発現の低下が検出された^[13]。

PRPN11は次に挙げる因子と相互作用することが示されている。