TATAボックス
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TATAボックスは、遺伝子の転写においてプロモーターとして機能し、その転写の開始位置を規定する配列といわれている。真核生物の場合ここに、基本転写因子のTFIIDが結合し、DNAの形を「ねじる」とされている[3]。
具体的な配列としては（5'-TATAA/TAA/TG-3'）などがある。
古細菌では（5'-TTTATATA-3'、5'-TTTTTAAA-3'）などいくつかの配列が知られている。なお、古細菌と真核生物のTATAボックスは、それぞれの結合因子を入れ替えても機能することが試験管内での実験により確かめられている。
実際にプロモーター領域に TATA ボックスを持つ遺伝子は、酵母において全体の 19 % 程度であり、他に転写の開始位置を規定する配列として、イニシエーターエレメント (Inr; initiator) などの存在が知られている[4][5]。
TATAボックスは真正細菌における、プリブノーボックス（Pribnow box;-10領域とも呼ばれる）に相当する[6]。こちらもTATAボックスと呼ばれることがある。
脚注
- ↑ Smale, Stephen T.; Kadonaga, James T. (2003). “The RNA polymerase II core promoter”. Annual Review of Biochemistry 72: 449–479. doi:10.1146/annurev.biochem.72.121801.161520. ISSN 0066-4154. PMID 12651739. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12651739/.
- ↑ Lifton, R. P.; Goldberg, M. L.; Karp, R. W.; Hogness, D. S. (1978). “The organization of the histone genes in Drosophila melanogaster: functional and evolutionary implications”. Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology 42 Pt 2: 1047–1051. ISSN 0091-7451. PMID 98262. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/98262/.
- ↑ Baptista, Tiago; Grünberg, Sebastian; Minoungou, Nadège; Koster, Maria J. E.; Timmers, H. T. Marc; Hahn, Steve; Devys, Didier; Tora, László (2017-10-05). “SAGA Is a General Cofactor for RNA Polymerase II Transcription”. Molecular Cell 68 (1): 130–143.e5. doi:10.1016/j.molcel.2017.08.016. ISSN 1097-4164. PMC 5632562. PMID 28918903. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28918903/.
- ↑ Basehoar, Andrew D.; Zanton, Sara J.; Pugh, B. Franklin (2004-03-05). “Identification and distinct regulation of yeast TATA box-containing genes”. Cell 116 (5): 699–709. ISSN 0092-8674. PMID 15006352. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15006352/.
- ↑ Yang, Chuhu; Bolotin, Eugene; Jiang, Tao; Sladek, Frances M.; Martinez, Ernest (2007-03-01). “Prevalence of the initiator over the TATA box in human and yeast genes and identification of DNA motifs enriched in human TATA-less core promoters”. Gene 389 (1): 52–65. doi:10.1016/j.gene.2006.09.029. ISSN 0378-1119. PMC 1955227. PMID 17123746. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17123746/.
- ↑ Pribnow, D. (March 1975). “Nucleotide sequence of an RNA polymerase binding site at an early T7 promoter”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 72 (3): 784–788. ISSN 0027-8424. PMID 1093168. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1093168/.