前作に比べ、名前付きのキャラクターは大幅に減少している。
元気と勇気いっぱいの主人公。これまでと同じく一言もしゃべらない。「しろボン」は初期設定の名前で、変更可能。
しろボンの親友で永遠のライバル。英語が得意。女性をナンパしていることもある。
みんなの憧れのお姉さん。我儘だが本当は優しい。今回はチャーリーと共にランドを回っている。
お金持ちのお坊ちゃん。威張りんぼだがどこか憎めない。ゴールド軍団のリーダー。
楽しいことが大好きで難しいことは嫌い。スポーツが得意だが、頭はあまり良くない。ゴールド軍団の一員でツッコミ役。
とにかく礼儀正しく頭が良いが、若干天然。ゴールド軍団の一員で参謀役。
レーサーを夢見る爽やかなお兄さん。今回はバイトではなくお客さんとして遊びに来た。
ボンバーマンランドの園長。「～ねん」と喋る。しろボンたちにランドへの招待状を送った。
プリティーボンバーの執事。「2」では彼女を連れ戻そうと奮闘していたが、今回は彼女と共に行動する。
あかボン、あかボンママ、あかボンパパの三人家族。今回はホテルに登場し、ほとんど本編に絡まない。また、あかボンは「ボンバーマンカート」でもプレイヤーキャラから外されている。
お馴染みの怪盗。イエローゾーンに出没し、三回発見すればピースをくれる。
怪盗ボンバーを追う警部。しろボンに怪盗ボンバーの捜索を依頼する。
少し変わった喋り方をするインタビュアー。イエローゾーンのキャッスル内で変装コンテストの司会をしている。
ホワイトゾーンのボンバータワーでディスクジョッキーをしている人物。音楽に関するクイズを出してくる。またしろボンをラジオ番組に出演させてくれる。
イベントステージで行われる「THEマンザイ」の出演者。コンビ名は「ボムアップダウン」。ボム・アップがツッコミ、ボム・ダウンがボケ。
ダーク軍団のリーダー。今回ダーク軍団はランドを占拠するなどの悪事はせず、全員スタッフとして働いている。ホワイトゾーンのイベントステージで行われている「ヒーローショウ」に出演している。
ダーク軍団の一員。ブルーゾーンの桟橋付近で潜っている。
ダーク軍団の一員。レッドゾーンのイベント「ウォンテッド」の変装した魔女として登場。
ダーク軍団の一員。イエローゾーンのイベント「早撃ちガンマン」の対戦相手として登場。
ダーク軍団の一員。レインボーゾーンの森の中にいる。
