三菱UFJモルガン・スタンレー証券

日興証券の離脱

日興證券は、三菱グループから支持され信頼を得てきたが、証券不祥事事件以降、証券不祥事を嫌う三菱グループを離れ、米国シティグループの証券子会社（後のSMBC日興証券とシティグループ証券）となった。社長が逮捕されるなど、自らの不祥事が問題の野村證券は、法令違反、不良債権など課題の多い系列下の三洋証券、国際証券を整理した。三洋は経営破綻し、国際証券株を、東京三菱銀行（現三菱UFJ銀行）に売却した。証券取引等監視委員会 （SESC）は、三菱グループ入りした国際証券を検査すると、いくつもの重大な法令違反行為の存在を見つけた。その結果、金融庁へ異例の厳しい行政処分を求める勧告を行うこととなった（2001年6月12日）^[8]。証券取引等監視委員会 （SESC）からの勧告を受けて、金融庁は、証券取引等監視委員会 （SESC）検査を軽視し、国の財務局長検査を組織ぐるみで妨害忌避した国際証券に対し、行政処分としては最も厳しい、すべての業務を禁止する(1) 業務停止命令 (2) 業務改善命令を行った（2001年6月18日）^[8]。国際証券は、三菱系列として金融当局の検査妨害を行い失落した。結果、三菱グループとして東京三菱銀行と日興証券が築いた証券市場での信用を壊した。

三菱証券の発足

2001年、東京三菱銀行を中核とする三菱東京フィナンシャル・グループ（MTFG）が発足。配下の証券会社を整理し、「東京三菱TDウォーターハウス証券」、東京三菱銀行の子会社の「東京三菱証券（旧・三菱ダイヤモンド証券）」と三菱信託銀行の子会社の「一成証券」、中小リテール証券の「東京三菱パーソナル証券（菱光証券：日興証券系、大七証券：山一証券系）合併」業務停止処分を受けた問題の「国際証券」統合を発表。

翌2002年10月1日に合併し「三菱証券」が発足。日興證券に代わる、三菱グループの総合証券会社となった。

三菱UFJ証券の発足（UFJつばさ証券と合併）

2005年10月1日、MTFGと、UFJ銀行を傘下に持つUFJホールディングスが合併、三菱UFJフィナンシャル・グループ（MUFG）発足。同時に、三菱証券がUFJつばさ証券（ユニバーサル証券・太平洋証券・東和証券・第一証券）と合併し、三菱UFJ証券となった。

MUFGの完全子会社化以後

2007年9月30日、株式交換でMUFGの完全子会社となり上場廃止。2016年現在、同じ持ち株会社の傘下にある三菱東京UFJ銀行、三菱UFJ信託銀行との共同店舗である「MUFGプラザ（旧・MTFGプラザ）」の出店を進めた。銀行の顧客基盤を活かしアプローチ。

モルガン・スタンレー日本法人投資銀行部門を統合

2009年3月26日、米国モルガン・スタンレーの日本法人モルガン・スタンレー証券との合併を発表^[9]。この発表で、2010年3月末、三菱UFJ60%、モルガン・スタンレー40%出資で全面統合予定であったが、2009年11月19日の三菱UFJフィナンシャル・グループの中間決算発表で、統合計画が1社へ全面統合から、モルガン・スタンレーの投資銀行部門のみ三菱UFJ証券側へ統合、モルガン・スタンレーの他部門は別会社として併存する2社体制を発表^[10]。

三菱UFJ証券が2009年12月1日に、三菱UFJ証券分割準備株式会社を設立。

2010年4月1日、会社分割し事業を移管、中間持株会社三菱UFJ証券ホールディングス株式会社、三菱UFJ証券分割準備株式会社が、（新）三菱UFJ証券株式会社^[11]。

その後、2010年5月1日、三菱UFJ証券にモルガン・スタンレー証券のインベストメントバンキング部門（100人規模）が合流、（三菱UFJ証券HD60％、モルガン・スタンレーHD40%出資）三菱UFJモルガン・スタンレー証券株式会社。

インベストメントバンキング部門を除くモルガン・スタンレー証券の他部門を継承する会社として、（三菱UFJ証券HD49％、モルガン・スタンレーHD51%出資）モルガン・スタンレーMUFG証券株式会社成立^[12]。

旧三菱UFJ証券（中小30社合併）

• 1944年（昭和19年） - 加賀証券設立。
• 1945年（昭和20年） - 南旺証券設立。
• 1948年（昭和23年） - 八千代証券設立。
• 1952年（昭和27年） - 南旺証券、鈴や証券、 鈴一証券に社名変更。
• 1953年（昭和28年） - 鈴一証券、一成証券(のち三菱信証券)に社名変更。
• 1969年（昭和44年） - 加賀証券、菱光証券に社名変更。
• 1981年（昭和56年）‐八千代証券、光亜証券、野村證券投資信託販売が合併、国際証券に社名変更。
• 1987年（昭和62年） - 国際証券、東証2部上場。（平成元年、東証一部上場。）
• 1994年（平成6年） - 三菱ダイヤモンド証券設立。
• 1996年（平成8年） - 三菱ダイヤモンド証券、東京三菱証券に社名変更。
• 1999年（平成11年） - 菱光証券、大七証券が合併。東京三菱パーソナル証券（未上場）に社名変更。
• 1999年（平成11年） - 東京三菱証券が、三菱信証券から業務譲受。
• 2001年（平成13年）6月12日 - 国際証券に対する、証券取引等監視委員会による検査の結果、法令違反行為が認められ、金融庁から(1)業務停止命令　(2)業務改善命令の行政処分^[8]。
• 2002年（平成14年）9月1日 - 東京三菱証券、東京三菱パーソナル証券、一成証券、国際証券が合併。三菱証券に社名変更。
• 2005年（平成17年）10月 - UFJつばさ証券と合併。（旧）三菱UFJ証券に社名変更。
• 2007年（平成19年）
  • 1月 - 2005年に常務取締役が未公表情報を得て株を不正購入。金融庁から業務改善命令の行政処分。
  • 4月 - 三菱UFJリサーチ&コンサルティング投資調査部を当社に移管。
  • 9月 - 三菱UFJフィナンシャル・グループの完全子会社となり、上場廃止。
• 2009年（平成21年）12月 - 子会社・三菱UFJ証券分割準備株式会社を設立。
• 2010年（平成22年）4月 - 事業を三菱UFJ証券分割準備株式会社へ譲渡。三菱UFJ証券ホールディングスに社名変更。

現法人

• 2009年（平成21年）12月 - 三菱UFJ証券分割準備株式会社設立。
• 2010年（平成22年）
  • 4月 - 従前の三菱UFJ証券株式会社が吸収分割を行い、同社の事業を譲受、三菱UFJ証券に社名変更。
  • 5月1日 - モルガン・スタンレーの日本法人であるモルガン・スタンレー証券株式会社の投資銀行部門について会社分割を行い、三菱UFJ証券株式会社が承継した上で、三菱UFJモルガン・スタンレー証券に社名変更。また、三菱UFJ証券ホールディングスが、モルガン・スタンレー証券に出資し、モルガン・スタンレー証券が、モルガン・スタンレーMUFG証券に社名変更。
• 2020年（令和2年）
  • 8月1日 - 三菱UFJモルガン・スタンレーPB証券を合併^[13]。