京都市内で発掘された埋蔵文化財を中心に展示を行うとともに文化財講習などのイベントを行う施設であり、1979年(昭和54年)11月に開館した。文化財の発掘、研究、保護などを目的に京都市を中心に設立された財団法人京都市埋蔵文化財研究所が、指定管理者として管理・運営を行っている。
館内は時代別、テーマ別などいくつかのコーナーに分け現物、レプリカ、写真などで展示されている。一部の展示物は写真撮影や手で触れることが可能である。建物は1914年(大正3年)に本野精吾の設計で建てられた旧西陣織物館を改修したもので、1984年(昭和59年)に京都市登録有形文化財に登録されている[3]。