安徽省立蚌埠高級工業職業学校として1945年創立。1947年秋、淮南洞山に移転し、昇格して当時の安徽省唯一の工科院校である安徽省立工業専科学校となる。1950年1月、淮南工業専門学校と改称、同年11月、淮南煤鉱専科学校と改称、同年11月、淮南煤鉱工業専科学校。1955年4月、淮南煤鉱工業専科学校は合肥鉱業学院に発展し、1956年合肥に移転し、1958年合肥工業大学と改称(1960年重点大学)。その後一部が分かれて安徽理工大学に発展している。
2005年より国家プロジェクト「211工程」による重点拠点大学の指定を受けている。