1993年と1995年、中国とアメリカの学者からなる合同調査隊がこの遺跡を調査発掘した。東南中国最古の土器が発見されている遺跡として知られる。遺跡の層位区分としてG層からB層までに分かれる。G層(12000 - 11000年前)は、プラントオパール分析により野生イネが存在する段階。F層(11000 - 10000年前)は、イネのプラントオパールが発見されていない。E層(10000 - 9000年前)は、土器が出現するとともに、野生イネだけでなく栽培イネが出現することがプラントオパール分析により判明した。D層(9000 - 8000年前)は、栽培イネが野生イネより着実に多くなることが、プラントオパール分析により示され、原始農耕の開始を予想している。C層(約7000年前)では、栽培イネのプラントオパールがより増え、さらに人骨のアイソトープ分析から、イネを食料源としていることが確かめられた。中国社会科学院考古研究所の趙志軍はプラントオパールの発見されていないF層に注目し、ヤンガードリアス期の寒冷化を想定している。
吊桶環遺跡から800mほどのところに仙人洞遺跡があり、当時においては密接に関係していたと見られている。