大分県国東半島沖の離島である姫島における本土との間の物流拠点であり、2008年の取扱貨物量は、264千フレート・トン[3]である。本港と国東港伊美地区（旧伊美港、町村合併により名称変更[3]）との間に、姫島村と大分県本土（国東市）を結ぶ定期フェリーが就航している。同フェリー航路は海上運送法に定める指定区間に指定されている。
また、港湾環境整備施設として姫島港運動公園も設置されており、姫島村が指定管理者となっている[4]。
2015年度の発着数は5,120隻（865,832総トン）[1]、利用客数は269,649人（乗込人員134,669人、上陸人員134,980人）である[2]。
