小出駅

上越線と只見線の2路線が乗り入れており、このうち上越線を所属線としている^[1]。なお、只見線は当駅が終点である。

以前は只見線の列車が上越線経由で浦佐駅まで乗り入れていたこともあったが、現在は行われていない（乗り入れていた期間については、只見線#冬季運休急行「奥只見」を参照）。

• 1923年（大正12年）9月1日：上越線の駅として開業^[2]。
• 1942年（昭和17年）11月1日：只見線が当駅から大白川駅まで開通し、分岐駅となる^[3]。
• 1958年（昭和33年）12月25日：駅舎を改築する^[4]。
• 1970年（昭和45年）12月15日：観光センターを開設^[5]。
• 1971年（昭和46年）8月29日：只見線が全通する^[6]。
• 1974年（昭和49年）5月：みどりの窓口の営業を開始^[7]。
• 1978年（昭和53年）12月：跨線橋が完成し、使用を開始^[8]。
• 1982年（昭和57年）11月15日：旅行センターを廃止（新幹線開業に伴う浦佐駅への旅行センター開設のため）^[9]。
• 1986年（昭和61年）10月20日：貨物の取り扱いを廃止^[1]。
• 1987年（昭和62年）4月1日：国鉄分割民営化により、東日本旅客鉄道の駅となる^[10]。
• 2011年（平成23年）8月26日：新駅舎の供用を開始^[11][12]。
• 2024年（令和6年）2月29日：みどりの窓口の営業を終了^[2]。

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  旧駅舎（2006年8月）

単式ホーム1面1線と島式ホーム2面4線を有する地上駅で、ホーム間は跨線橋で連絡している。

JR東日本新潟シティクリエイト（JENIC）受託の業務委託駅で、越後湯沢駅が管理する。駅構内には有人改札口、自動券売機、屋内待合室、自動販売機、化粧室などが設置されている。また、駅舎には、当地出身の俳優・渡辺謙が書いた駅名表示が設置されている。旧駅舎時代は売店（キヨスク）や立ち食い蕎麦店が存在し、駅弁も取り扱っていた。

みどりの窓口の営業を終了した後は、POS端末で乗車券や自由席特急券を発券する他、補充券で指定席券も発券している。

JR東日本によると、2024年度（令和6年度）の1日平均乗車人員は675人である^{[利用客数 1]}。

2000年度（平成12年度）以降の推移は以下のとおりである。

小出の市街地は、駅舎裏手を流れる魚野川を挟んだ対岸に広がっており^[14]、新潟県道47号小出停車場線や小出橋により連絡している。また、当駅から路線バスでアクセスできる観光スポットとして、湯之谷温泉郷がある。

• 市営小出スキー場・小出公園（徒歩5分）
• 新潟県立小出高等学校

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  駅（右下）のすぐ脇を流れる魚野川
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  右岸の小出市街

越後交通グループの南越後観光バスが運行する路線バス、および魚沼市のコミュニティバスが当駅前を発着、または周辺を経由する。前者の主要路線には英字2文字の路線記号を付与したが、これは停留所にのみ掲載され、バス車体には表示されないため要注意である。

東日本旅客鉄道（JR東日本）

■上越線

八色駅 - 小出駅 - 越後堀之内駅

■只見線

藪神駅 - 小出駅