ここでは単発・シリーズなど様々な形で発行された増刊号を紹介。
- 特別編集として1986年から1987年にかけて刊行。
- 特別編集スペシャル増刊として1988年から1989年にかけて刊行。
- 1991年から1992年にかけて刊行。
- 名探偵コナン＆金田一少年の事件簿
- 『週刊少年サンデー』（小学館）と『週刊少年マガジン』（講談社）の創刊50周年記念のコラボ企画「コナン&金田一」の一環として2008年に発刊。12冊のうち奇数号がサンデーの増刊にあたる。
- 少年サンデー25
- 1984年4月発売。創刊25周年の記念増刊。掲載作品は全て新作・読み切りだった。
- 犬夜叉 キャラクター登場編
- 『犬夜叉』の主要キャラの初登場エピソードやアニメの情報などを掲載した特別編集増刊。2001年に発刊。
- 犬夜叉
- オリジナルの描き下ろし作品『犬夜叉VS殺生丸』を収録。2003年に発刊。
- 野球増刊SCUD
- 野球関係の企画と14本の野球まんがで構成された。2007年刊行。
- 週刊少年サンデー プレミアム号 永久保存版 特別増刊記念号[1]
- 2008年に抽選でプレゼントされた非売品。2000年代ヒット作品の第一話が収録されている。
- 少年サンデー1983
- 『サンデー』の創刊50周年記念の特別増刊として発刊。1983年当時の『サンデー』の主力連載作品や表紙などを収録[2]。また、「スペシャルインタビュー黄金時代9人の作家」として1983年当時のサンデー連載人気漫画家（あだち充、高橋留美子、村上もとか、新谷かおる、細野不二彦、原秀則、石渡治、岡崎つぐお、島本和彦）、およびその他連載陣10人のインタビューを掲載した[2]。
