明暦3年（1657年）9月6日、美作津山藩の第2代藩主（後に備中西江原藩の初代藩主）・森長継の六男（九男との説もある）として生まれる。寛文9年（1669年）5月、叔父の美作宮川藩主・関長政の養子となり、元禄2年（1689年）に家督を継いだ。元禄10年（1697年）、本家森家の津山藩が5代目襲封予定であった森衆利（長治の弟）の発狂により改易されたため、備中に移封されて新見藩を立藩した。
藩政においては新たな領国における藩政を固めるため、自ら率先して倹約に努め、植林や農業政策、牧畜政策を奨励し、商業政策にも従事して藩政の基礎を固めることに成功した。
享保10年（1725年）3月5日、兄・森長俊の次男・長広を養子として家督を譲り隠居する。元文3年（1738年）8月11日に死去した。享年82。
