À sa retraite de joueur, Labourdette devient un président emblématique de la Section paloise. Sous sa direction, le club entre pleinement dans le professionnalisme, remporte le Challenge Yves du Manoir en 1996-1997 et atteint la demi-finale du championnat en 1995-1996. Au niveau continental, Labourdette conduit les sectionnistes en demi-finale de la Coupe d'Europe de rugby à XV en 1997-1998.
Pierre Labourdette rejoint la Section paloise en 1956, faisant ses débuts le contre le SU Agen[5]. Ses prestations attirent l'attention et le désignent comme un espoir prometteur pour le club, même si sa carrière professionnelle reste une priorité[6].
En , la Section paloise organise un match à Sauveterre-de-Béarn, sa ville natale, contre le Stade montois pour l'inauguration du nouveau stade local[7].
Pierre Labourdette devient ensuite directeur commercial d'une société d'engrais et revient s'établir en Béarn[2].
Dans les années 1980, il occupe les postes de secrétaire de l’école de rugby à la Section paloise, puis de vice-président du club à partir de 1989[2].
Pierre Labourdette devient président de la Section paloise en 1994, succédant à Yves Tour[10]. André Lestorte et Jean Othax sont nommés présidents délégués[11]. Labourdette réussit à redresser le club[12], l'introduit dans l'ère du professionnalisme[13], et en fait une institution respectée tant en France qu'en Europe[14]. Sous la direction du duo d'entraîneurs Léta et Luneau, avec le soutien d'Henri Nieto, le club traverse une période pleine de succès: finale du Challenge Yves du Manoir contre le CA Brive en 1996, demi-finale du championnat la même année contre Brive, et victoire de la Coupe de France en 1997 contre Bourgoin lors de la finale de Nîmes[15]. Labourdette est un président fort apprécié des joueurs clés de l'effectif, comme Alain Lagouarde ou Pierre Triep-Capdeville[16].
Il permet à la Section de faire une transition réussie vers l'ère du professionnalisme. Avec élégance et conviction, il a su passer le relais lors de la création de la première Société anonyme à objet sportif en France[17]. En effet, en 1998, Labourdette est confronté à une fronde menée par Lestorte[18].
Cependant, en raison de l'importance croissante de la Section, il entre en conflit avec Bernard Laporte-Fray, président du Pau FC, nécessitant l'intervention du maire André Labarrère[19].
En 2005, alors qu'il est vice-président du comité Béarn de rugby, Labourdette, accompagné d'anciens présidents de la Section comme François Moncla et Gérard Lom, critique la gestion de la Section paloise par André Lestorte[20]. Cette opposition conduit à la nomination de Joachim Alvarez, puis à celle de Bernard Pontneau en 2006.
Pierre Labourdette décède à Pau le , à l'âge de 92 ans[21].