EcoRII

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PDB ID 1NA6に基づいたEco RII二量体

EcoRII (えこあーるつー)とは、Escherichia coli見られる制限修飾系(RM)の制限酵素(REase)である。その分子量は45.2 kDaであり、402残基のアミノ酸で構成されている[1]

EcoRIIは真正細菌のタイプIIE [2] REaseである。疑似回文構造のDNA 認識配列 5' - CC W GG - 3' (W = AまたはT )の2個[3]または3個 [4] (このうち1個は実際に標的を切断し、残りはアロステリックアクチベーターとして機能する)と相互作用する。 EcoRIIは、粘着末端を生成する標的DNA配列CCWGGを切断する[5]

切断様式の図式

認識部位 切断結果
 5 'NN CCWGG NN
 3 'NN GGWCC NN 
 5 'NN CCWGG NN
 3 'NN GGWCC NN 

構造

外部リンク

脚注

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